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[matrix] Diff of /pkg/src/Csparse.c
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Diff of /pkg/src/Csparse.c

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revision 1059, Wed Nov 23 22:20:13 2005 UTC revision 1353, Tue Aug 8 14:54:12 2006 UTC
# Line 1  Line 1 
1                          /* Sparse matrices in compress column-oriented form */                          /* Sparse matrices in compressed column-oriented form */
2  #include "Csparse.h"  #include "Csparse.h"
3  #include "chm_common.h"  #include "chm_common.h"
4    
# Line 34  Line 34 
34      cholmod_sparse *chxs = as_cholmod_sparse(x);      cholmod_sparse *chxs = as_cholmod_sparse(x);
35      cholmod_dense *chxd = cholmod_sparse_to_dense(chxs, &c);      cholmod_dense *chxd = cholmod_sparse_to_dense(chxs, &c);
36    
37      free(chxs);      Free(chxs);
38      return chm_dense_to_SEXP(chxd, 1);      return chm_dense_to_SEXP(chxd, 1);
39  }  }
40    
# Line 43  Line 43 
43      cholmod_sparse *chxs = as_cholmod_sparse(x);      cholmod_sparse *chxs = as_cholmod_sparse(x);
44      cholmod_triplet *chxt = cholmod_sparse_to_triplet(chxs, &c);      cholmod_triplet *chxt = cholmod_sparse_to_triplet(chxs, &c);
45    
46      free(chxs);      Free(chxs);
47      return chm_triplet_to_SEXP(chxt, 1);      return chm_triplet_to_SEXP(chxt, 1);
48  }  }
49    
# Line 52  Line 52 
52      cholmod_sparse *chx = as_cholmod_sparse(x);      cholmod_sparse *chx = as_cholmod_sparse(x);
53      cholmod_sparse *chxt = cholmod_transpose(chx, (int) chx->xtype, &c);      cholmod_sparse *chxt = cholmod_transpose(chx, (int) chx->xtype, &c);
54    
55      free(chx);      Free(chx);
56      return chm_sparse_to_SEXP(chxt, 1);      return chm_sparse_to_SEXP(chxt, 1);
57  }  }
58    
# Line 62  Line 62 
62          *chb = as_cholmod_sparse(b);          *chb = as_cholmod_sparse(b);
63      cholmod_sparse *chc = cholmod_ssmult(cha, chb, 0, cha->xtype, 1, &c);      cholmod_sparse *chc = cholmod_ssmult(cha, chb, 0, cha->xtype, 1, &c);
64    
65      free(cha); free(chb);      Free(cha); Free(chb);
66      return chm_sparse_to_SEXP(chc, 1);      return chm_sparse_to_SEXP(chc, 1);
67  }  }
68    
# Line 75  Line 75 
75      double alpha = 1, beta = 0;      double alpha = 1, beta = 0;
76    
77      cholmod_sdmult(cha, 0, &alpha, &beta, chb, chc, &c);      cholmod_sdmult(cha, 0, &alpha, &beta, chb, chc, &c);
78      free(cha); free(chb);      Free(cha); Free(chb);
79        return chm_dense_to_SEXP(chc, 1);
80    }
81    
82    SEXP Csparse_dense_crossprod(SEXP a, SEXP b)
83    {
84        cholmod_sparse *cha = as_cholmod_sparse(a);
85        cholmod_dense *chb = as_cholmod_dense(b);
86        cholmod_dense *chc = cholmod_allocate_dense(cha->ncol, chb->ncol,
87                                                    cha->ncol, chb->xtype, &c);
88        double alpha = 1, beta = 0;
89    
90        cholmod_sdmult(cha, 1, &alpha, &beta, chb, chc, &c);
91        Free(cha); Free(chb);
92      return chm_dense_to_SEXP(chc, 1);      return chm_dense_to_SEXP(chc, 1);
93  }  }
94    
# Line 90  Line 103 
103          : as_cholmod_sparse(x);          : as_cholmod_sparse(x);
104    
105      if (!tr)      if (!tr)
106          chxt = cholmod_transpose(chx, (int) chx->xtype, &c);          chxt = cholmod_transpose(chx, chx->xtype, &c);
107      chcp = cholmod_aat((!tr) ? chxt : chx, (int *) NULL, 0, chx->xtype, &c);      chcp = cholmod_aat((!tr) ? chxt : chx, (int *) NULL, 0, chx->xtype, &c);
108      if(!chcp)      if(!chcp)
109          error("Csparse_crossprod(): error return from cholmod_aat()");          error("Csparse_crossprod(): error return from cholmod_aat()");
110        cholmod_band_inplace((tr) ? -(chcp->nrow) : 0, (tr) ? 0 : chcp->ncol,
111                             chcp->xtype, chcp, &c);
112        chcp->stype = (tr) ? -1 : 1;
113      if (trip) {      if (trip) {
114          cholmod_free_sparse(&chx, &c);          cholmod_free_sparse(&chx, &c);
115          free(cht);          Free(cht);
116      } else {      } else {
117          free(chx);          Free(chx);
118      }      }
119      if (!tr) cholmod_free_sparse(&chxt, &c);      if (!tr) cholmod_free_sparse(&chxt, &c);
120      return chm_sparse_to_SEXP(chcp, 1);      return chm_sparse_to_SEXP(chcp, 1);
121  }  }
122    
123    SEXP Csparse_horzcat(SEXP x, SEXP y)
124    {
125        cholmod_sparse *chx = as_cholmod_sparse(x),
126            *chy = as_cholmod_sparse(y), *ans;
127    
128        ans = cholmod_horzcat(chx, chy, 1, &c);
129        Free(chx); Free(chy);
130        return chm_sparse_to_SEXP(ans, 1);
131    }
132    
133    SEXP Csparse_vertcat(SEXP x, SEXP y)
134    {
135        cholmod_sparse *chx = as_cholmod_sparse(x),
136            *chy = as_cholmod_sparse(y), *ans;
137    
138        ans = cholmod_vertcat(chx, chy, 1, &c);
139        Free(chx); Free(chy);
140        return chm_sparse_to_SEXP(ans, 1);
141    }
142    
143    SEXP Csparse_band(SEXP x, SEXP k1, SEXP k2)
144    {
145        cholmod_sparse *chx = as_cholmod_sparse(x), *ans;
146    
147        ans = cholmod_band(chx, asInteger(k1), asInteger(k2), chx->xtype, &c);
148        Free(chx);
149        return chm_sparse_to_SEXP(ans, 1);
150    }

Legend:
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changed lines
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