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[matrix] Annotation of /pkg/src/Csparse.c
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Annotation of /pkg/src/Csparse.c

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1 : bates 1218 /* Sparse matrices in compressed column-oriented form */
2 : bates 922 #include "Csparse.h"
3 : maechler 2120 #include "Tsparse.h"
4 : bates 922 #include "chm_common.h"
5 :    
6 :     SEXP Csparse_validate(SEXP x)
7 :     {
8 : maechler 1575 /* NB: we do *NOT* check a potential 'x' slot here, at all */
9 : bates 922 SEXP pslot = GET_SLOT(x, Matrix_pSym),
10 :     islot = GET_SLOT(x, Matrix_iSym);
11 : maechler 1893 Rboolean sorted, strictly;
12 :     int j, k,
13 : bates 922 *dims = INTEGER(GET_SLOT(x, Matrix_DimSym)),
14 : maechler 1660 nrow = dims[0],
15 :     ncol = dims[1],
16 : maechler 1654 *xp = INTEGER(pslot),
17 : bates 922 *xi = INTEGER(islot);
18 :    
19 : maechler 1654 if (length(pslot) != dims[1] + 1)
20 :     return mkString(_("slot p must have length = ncol(.) + 1"));
21 : bates 922 if (xp[0] != 0)
22 :     return mkString(_("first element of slot p must be zero"));
23 : maechler 1893 if (length(islot) < xp[ncol]) /* allow larger slots from over-allocation!*/
24 : bates 1555 return
25 :     mkString(_("last element of slot p must match length of slots i and x"));
26 :     for (j = 0; j < length(islot); j++) {
27 :     if (xi[j] < 0 || xi[j] >= nrow)
28 :     return mkString(_("all row indices must be between 0 and nrow-1"));
29 :     }
30 : maechler 1893 sorted = TRUE; strictly = TRUE;
31 : bates 922 for (j = 0; j < ncol; j++) {
32 :     if (xp[j] > xp[j+1])
33 :     return mkString(_("slot p must be non-decreasing"));
34 : maechler 1893 if(sorted)
35 :     for (k = xp[j] + 1; k < xp[j + 1]; k++) {
36 :     if (xi[k] < xi[k - 1])
37 :     sorted = FALSE;
38 :     else if (xi[k] == xi[k - 1])
39 :     strictly = FALSE;
40 :     }
41 : bates 922 }
42 : maechler 1654 if (!sorted) {
43 : maechler 1960 CHM_SP chx = AS_CHM_SP(x);
44 :     R_CheckStack();
45 :    
46 : maechler 1654 cholmod_sort(chx, &c);
47 : maechler 1893 /* Now re-check that row indices are *strictly* increasing
48 :     * (and not just increasing) within each column : */
49 :     for (j = 0; j < ncol; j++) {
50 :     for (k = xp[j] + 1; k < xp[j + 1]; k++)
51 :     if (xi[k] == xi[k - 1])
52 :     return mkString(_("slot i is not *strictly* increasing inside a column (even after cholmod_sort)"));
53 :     }
54 :    
55 :     } else if(!strictly) { /* sorted, but not strictly */
56 :     return mkString(_("slot i is not *strictly* increasing inside a column"));
57 : maechler 1654 }
58 : bates 922 return ScalarLogical(1);
59 :     }
60 :    
61 : maechler 1968 SEXP Rsparse_validate(SEXP x)
62 :     {
63 :     /* NB: we do *NOT* check a potential 'x' slot here, at all */
64 :     SEXP pslot = GET_SLOT(x, Matrix_pSym),
65 :     jslot = GET_SLOT(x, Matrix_jSym);
66 :     Rboolean sorted, strictly;
67 :     int i, k,
68 :     *dims = INTEGER(GET_SLOT(x, Matrix_DimSym)),
69 :     nrow = dims[0],
70 :     ncol = dims[1],
71 :     *xp = INTEGER(pslot),
72 :     *xj = INTEGER(jslot);
73 :    
74 :     if (length(pslot) != dims[0] + 1)
75 :     return mkString(_("slot p must have length = nrow(.) + 1"));
76 :     if (xp[0] != 0)
77 :     return mkString(_("first element of slot p must be zero"));
78 :     if (length(jslot) < xp[nrow]) /* allow larger slots from over-allocation!*/
79 :     return
80 :     mkString(_("last element of slot p must match length of slots j and x"));
81 :     for (i = 0; i < length(jslot); i++) {
82 :     if (xj[i] < 0 || xj[i] >= ncol)
83 :     return mkString(_("all column indices must be between 0 and ncol-1"));
84 :     }
85 :     sorted = TRUE; strictly = TRUE;
86 :     for (i = 0; i < nrow; i++) {
87 :     if (xp[i] > xp[i+1])
88 :     return mkString(_("slot p must be non-decreasing"));
89 :     if(sorted)
90 :     for (k = xp[i] + 1; k < xp[i + 1]; k++) {
91 :     if (xj[k] < xj[k - 1])
92 :     sorted = FALSE;
93 :     else if (xj[k] == xj[k - 1])
94 :     strictly = FALSE;
95 :     }
96 :     }
97 :     if (!sorted)
98 :     /* cannot easily use cholmod_sort(.) ... -> "error out" :*/
99 :     return mkString(_("slot j is not increasing inside a column"));
100 :     else if(!strictly) /* sorted, but not strictly */
101 :     return mkString(_("slot j is not *strictly* increasing inside a column"));
102 :    
103 :     return ScalarLogical(1);
104 :     }
105 :    
106 :    
107 : maechler 1751 /* Called from ../R/Csparse.R : */
108 :     /* Can only return [dln]geMatrix (no symm/triang);
109 :     * FIXME: replace by non-CHOLMOD code ! */
110 : bates 1059 SEXP Csparse_to_dense(SEXP x)
111 :     {
112 : maechler 1960 CHM_SP chxs = AS_CHM_SP(x);
113 : maechler 1751 /* This loses the symmetry property, since cholmod_dense has none,
114 :     * BUT, much worse (FIXME!), it also transforms CHOLMOD_PATTERN ("n") matrices
115 :     * to numeric (CHOLMOD_REAL) ones : */
116 : maechler 1960 CHM_DN chxd = cholmod_sparse_to_dense(chxs, &c);
117 : maechler 1751 int Rkind = (chxs->xtype == CHOLMOD_PATTERN)? -1 : Real_kind(x);
118 : maechler 1960 R_CheckStack();
119 : bates 1059
120 : maechler 1736 return chm_dense_to_SEXP(chxd, 1, Rkind, GET_SLOT(x, Matrix_DimNamesSym));
121 : bates 1059 }
122 :    
123 : maechler 1548 SEXP Csparse_to_nz_pattern(SEXP x, SEXP tri)
124 : bates 1371 {
125 : maechler 1960 CHM_SP chxs = AS_CHM_SP(x);
126 :     CHM_SP chxcp = cholmod_copy(chxs, chxs->stype, CHOLMOD_PATTERN, &c);
127 : bates 1867 int tr = asLogical(tri);
128 : maechler 1960 R_CheckStack();
129 : bates 1371
130 : maechler 1960 return chm_sparse_to_SEXP(chxcp, 1/*do_free*/,
131 : bates 1867 tr ? ((*uplo_P(x) == 'U') ? 1 : -1) : 0,
132 :     0, tr ? diag_P(x) : "",
133 : maechler 1548 GET_SLOT(x, Matrix_DimNamesSym));
134 : bates 1371 }
135 :    
136 : bates 1366 SEXP Csparse_to_matrix(SEXP x)
137 : bates 922 {
138 : maechler 1960 return chm_dense_to_matrix(cholmod_sparse_to_dense(AS_CHM_SP(x), &c),
139 :     1 /*do_free*/, GET_SLOT(x, Matrix_DimNamesSym));
140 : bates 1366 }
141 :    
142 :     SEXP Csparse_to_Tsparse(SEXP x, SEXP tri)
143 :     {
144 : maechler 1960 CHM_SP chxs = AS_CHM_SP(x);
145 :     CHM_TR chxt = cholmod_sparse_to_triplet(chxs, &c);
146 : bates 1867 int tr = asLogical(tri);
147 : maechler 1736 int Rkind = (chxs->xtype != CHOLMOD_PATTERN) ? Real_kind(x) : 0;
148 : maechler 1960 R_CheckStack();
149 : bates 922
150 : bates 1867 return chm_triplet_to_SEXP(chxt, 1,
151 :     tr ? ((*uplo_P(x) == 'U') ? 1 : -1) : 0,
152 :     Rkind, tr ? diag_P(x) : "",
153 : bates 1371 GET_SLOT(x, Matrix_DimNamesSym));
154 : bates 922 }
155 :    
156 : bates 1448 /* this used to be called sCMatrix_to_gCMatrix(..) [in ./dsCMatrix.c ]: */
157 : bates 1371 SEXP Csparse_symmetric_to_general(SEXP x)
158 :     {
159 : maechler 1960 CHM_SP chx = AS_CHM_SP(x), chgx;
160 : maechler 1736 int Rkind = (chx->xtype != CHOLMOD_PATTERN) ? Real_kind(x) : 0;
161 : maechler 1960 R_CheckStack();
162 : bates 1371
163 :     if (!(chx->stype))
164 : maechler 1548 error(_("Nonsymmetric matrix in Csparse_symmetric_to_general"));
165 : maechler 1375 chgx = cholmod_copy(chx, /* stype: */ 0, chx->xtype, &c);
166 :     /* xtype: pattern, "real", complex or .. */
167 : maechler 1548 return chm_sparse_to_SEXP(chgx, 1, 0, Rkind, "",
168 : bates 1371 GET_SLOT(x, Matrix_DimNamesSym));
169 :     }
170 :    
171 : maechler 1618 SEXP Csparse_general_to_symmetric(SEXP x, SEXP uplo)
172 : maechler 1598 {
173 : maechler 1960 CHM_SP chx = AS_CHM_SP(x), chgx;
174 : maechler 2113 int uploT = (*CHAR(STRING_ELT(uplo,0)) == 'U') ? 1 : -1;
175 : maechler 1736 int Rkind = (chx->xtype != CHOLMOD_PATTERN) ? Real_kind(x) : 0;
176 : maechler 1960 R_CheckStack();
177 : maechler 1598
178 : maechler 1618 chgx = cholmod_copy(chx, /* stype: */ uploT, chx->xtype, &c);
179 : maechler 1598 /* xtype: pattern, "real", complex or .. */
180 :     return chm_sparse_to_SEXP(chgx, 1, 0, Rkind, "",
181 :     GET_SLOT(x, Matrix_DimNamesSym));
182 :     }
183 :    
184 : bates 1369 SEXP Csparse_transpose(SEXP x, SEXP tri)
185 : bates 922 {
186 : maechler 1921 /* TODO: lgCMatrix & igC* currently go via double prec. cholmod -
187 :     * since cholmod (& cs) lacks sparse 'int' matrices */
188 : maechler 1960 CHM_SP chx = AS_CHM_SP(x);
189 : maechler 1736 int Rkind = (chx->xtype != CHOLMOD_PATTERN) ? Real_kind(x) : 0;
190 : maechler 1960 CHM_SP chxt = cholmod_transpose(chx, chx->xtype, &c);
191 : bates 1366 SEXP dn = PROTECT(duplicate(GET_SLOT(x, Matrix_DimNamesSym))), tmp;
192 : bates 1867 int tr = asLogical(tri);
193 : maechler 1960 R_CheckStack();
194 : bates 1369
195 : bates 1366 tmp = VECTOR_ELT(dn, 0); /* swap the dimnames */
196 :     SET_VECTOR_ELT(dn, 0, VECTOR_ELT(dn, 1));
197 :     SET_VECTOR_ELT(dn, 1, tmp);
198 :     UNPROTECT(1);
199 : bates 1867 return chm_sparse_to_SEXP(chxt, 1, /* SWAP 'uplo' for triangular */
200 :     tr ? ((*uplo_P(x) == 'U') ? -1 : 1) : 0,
201 :     Rkind, tr ? diag_P(x) : "", dn);
202 : bates 922 }
203 :    
204 :     SEXP Csparse_Csparse_prod(SEXP a, SEXP b)
205 :     {
206 : maechler 2120 CHM_SP
207 :     cha = AS_CHM_SP(Csparse_diagU2N(a)),
208 :     chb = AS_CHM_SP(Csparse_diagU2N(b)),
209 :     chc = cholmod_ssmult(cha, chb, 0, cha->xtype, 1, &c);
210 : bates 1366 SEXP dn = allocVector(VECSXP, 2);
211 : maechler 1960 R_CheckStack();
212 : bates 922
213 : bates 1366 SET_VECTOR_ELT(dn, 0, /* establish dimnames */
214 :     duplicate(VECTOR_ELT(GET_SLOT(a, Matrix_DimNamesSym), 0)));
215 :     SET_VECTOR_ELT(dn, 1,
216 :     duplicate(VECTOR_ELT(GET_SLOT(b, Matrix_DimNamesSym), 1)));
217 : maechler 1548 return chm_sparse_to_SEXP(chc, 1, 0, 0, "", dn);
218 : bates 922 }
219 :    
220 : maechler 1659 SEXP Csparse_Csparse_crossprod(SEXP a, SEXP b, SEXP trans)
221 : bates 1657 {
222 : maechler 1659 int tr = asLogical(trans);
223 : maechler 2120 CHM_SP
224 :     cha = AS_CHM_SP(Csparse_diagU2N(a)),
225 :     chb = AS_CHM_SP(Csparse_diagU2N(b)),
226 :     chTr, chc;
227 : bates 1657 SEXP dn = allocVector(VECSXP, 2);
228 : maechler 1960 R_CheckStack();
229 : bates 1657
230 : maechler 1960 chTr = cholmod_transpose((tr) ? chb : cha, chb->xtype, &c);
231 : maechler 1659 chc = cholmod_ssmult((tr) ? cha : chTr, (tr) ? chTr : chb,
232 :     0, cha->xtype, 1, &c);
233 : maechler 1960 cholmod_free_sparse(&chTr, &c);
234 : maechler 1659
235 : bates 1657 SET_VECTOR_ELT(dn, 0, /* establish dimnames */
236 : maechler 1659 duplicate(VECTOR_ELT(GET_SLOT(a, Matrix_DimNamesSym), (tr) ? 0 : 1)));
237 : bates 1657 SET_VECTOR_ELT(dn, 1,
238 : maechler 1659 duplicate(VECTOR_ELT(GET_SLOT(b, Matrix_DimNamesSym), (tr) ? 0 : 1)));
239 : bates 1657 return chm_sparse_to_SEXP(chc, 1, 0, 0, "", dn);
240 :     }
241 :    
242 : bates 922 SEXP Csparse_dense_prod(SEXP a, SEXP b)
243 :     {
244 : maechler 2120 CHM_SP cha = AS_CHM_SP(Csparse_diagU2N(a));
245 : maechler 1660 SEXP b_M = PROTECT(mMatrix_as_dgeMatrix(b));
246 : maechler 1960 CHM_DN chb = AS_CHM_DN(b_M);
247 :     CHM_DN chc = cholmod_allocate_dense(cha->nrow, chb->ncol, cha->nrow,
248 :     chb->xtype, &c);
249 :     SEXP dn = PROTECT(allocVector(VECSXP, 2));
250 :     double one[] = {1,0}, zero[] = {0,0};
251 :     R_CheckStack();
252 : bates 922
253 : maechler 1960 cholmod_sdmult(cha, 0, one, zero, chb, chc, &c);
254 : maechler 1660 SET_VECTOR_ELT(dn, 0, /* establish dimnames */
255 :     duplicate(VECTOR_ELT(GET_SLOT(a, Matrix_DimNamesSym), 0)));
256 :     SET_VECTOR_ELT(dn, 1,
257 :     duplicate(VECTOR_ELT(GET_SLOT(b_M, Matrix_DimNamesSym), 1)));
258 : maechler 1960 UNPROTECT(2);
259 : maechler 1660 return chm_dense_to_SEXP(chc, 1, 0, dn);
260 : bates 922 }
261 : maechler 925
262 : bates 1067 SEXP Csparse_dense_crossprod(SEXP a, SEXP b)
263 :     {
264 : maechler 2120 CHM_SP cha = AS_CHM_SP(Csparse_diagU2N(a));
265 : maechler 1660 SEXP b_M = PROTECT(mMatrix_as_dgeMatrix(b));
266 : maechler 1960 CHM_DN chb = AS_CHM_DN(b_M);
267 :     CHM_DN chc = cholmod_allocate_dense(cha->ncol, chb->ncol, cha->ncol,
268 :     chb->xtype, &c);
269 :     SEXP dn = PROTECT(allocVector(VECSXP, 2));
270 :     double one[] = {1,0}, zero[] = {0,0};
271 :     R_CheckStack();
272 : bates 1067
273 : maechler 1960 cholmod_sdmult(cha, 1, one, zero, chb, chc, &c);
274 : maechler 1660 SET_VECTOR_ELT(dn, 0, /* establish dimnames */
275 :     duplicate(VECTOR_ELT(GET_SLOT(a, Matrix_DimNamesSym), 1)));
276 :     SET_VECTOR_ELT(dn, 1,
277 :     duplicate(VECTOR_ELT(GET_SLOT(b_M, Matrix_DimNamesSym), 1)));
278 : maechler 1960 UNPROTECT(2);
279 : maechler 1660 return chm_dense_to_SEXP(chc, 1, 0, dn);
280 : bates 1067 }
281 :    
282 : maechler 1659 /* Computes x'x or x x' -- see Csparse_Csparse_crossprod above for x'y and x y' */
283 : bates 928 SEXP Csparse_crossprod(SEXP x, SEXP trans, SEXP triplet)
284 : bates 922 {
285 : maechler 957 int trip = asLogical(triplet),
286 :     tr = asLogical(trans); /* gets reversed because _aat is tcrossprod */
287 : maechler 2120 CHM_TR cht = trip ? AS_CHM_TR(Tsparse_diagU2N(x)) : (CHM_TR) NULL;
288 : maechler 1960 CHM_SP chcp, chxt,
289 : maechler 2120 chx = (trip ?
290 :     cholmod_triplet_to_sparse(cht, cht->nnz, &c) :
291 :     AS_CHM_SP(Csparse_diagU2N(x)));
292 : bates 1366 SEXP dn = PROTECT(allocVector(VECSXP, 2));
293 : maechler 1960 R_CheckStack();
294 : bates 922
295 : maechler 1960 if (!tr) chxt = cholmod_transpose(chx, chx->xtype, &c);
296 : bates 928 chcp = cholmod_aat((!tr) ? chxt : chx, (int *) NULL, 0, chx->xtype, &c);
297 : maechler 2120 if(!chcp) {
298 :     UNPROTECT(1);
299 :     error(_("Csparse_crossprod(): error return from cholmod_aat()"));
300 :     }
301 : bates 1360 cholmod_band_inplace(0, chcp->ncol, chcp->xtype, chcp, &c);
302 :     chcp->stype = 1;
303 : maechler 1960 if (trip) cholmod_free_sparse(&chx, &c);
304 : bates 923 if (!tr) cholmod_free_sparse(&chxt, &c);
305 : maechler 1960 SET_VECTOR_ELT(dn, 0, /* establish dimnames */
306 : bates 1366 duplicate(VECTOR_ELT(GET_SLOT(x, Matrix_DimNamesSym),
307 : maechler 1660 (tr) ? 0 : 1)));
308 : bates 1366 SET_VECTOR_ELT(dn, 1, duplicate(VECTOR_ELT(dn, 0)));
309 :     UNPROTECT(1);
310 : maechler 1548 return chm_sparse_to_SEXP(chcp, 1, 0, 0, "", dn);
311 : bates 922 }
312 : bates 923
313 : maechler 1618 SEXP Csparse_drop(SEXP x, SEXP tol)
314 :     {
315 : maechler 1960 CHM_SP chx = AS_CHM_SP(x);
316 :     CHM_SP ans = cholmod_copy(chx, chx->stype, chx->xtype, &c);
317 : maechler 1618 double dtol = asReal(tol);
318 : maechler 1736 int Rkind = (chx->xtype != CHOLMOD_PATTERN) ? Real_kind(x) : 0;
319 : maechler 1960 R_CheckStack();
320 : maechler 1618
321 :     if(!cholmod_drop(dtol, ans, &c))
322 :     error(_("cholmod_drop() failed"));
323 : maechler 1736 return chm_sparse_to_SEXP(ans, 1, 0, Rkind, "",
324 :     GET_SLOT(x, Matrix_DimNamesSym));
325 : maechler 1618 }
326 :    
327 : bates 1218 SEXP Csparse_horzcat(SEXP x, SEXP y)
328 :     {
329 : maechler 1960 CHM_SP chx = AS_CHM_SP(x), chy = AS_CHM_SP(y);
330 : maechler 1548 int Rkind = 0; /* only for "d" - FIXME */
331 : maechler 1960 R_CheckStack();
332 : maechler 1375
333 : bates 1366 /* FIXME: currently drops dimnames */
334 : maechler 1960 return chm_sparse_to_SEXP(cholmod_horzcat(chx, chy, 1, &c),
335 :     1, 0, Rkind, "", R_NilValue);
336 : bates 1218 }
337 :    
338 :     SEXP Csparse_vertcat(SEXP x, SEXP y)
339 :     {
340 : maechler 1960 CHM_SP chx = AS_CHM_SP(x), chy = AS_CHM_SP(y);
341 : maechler 1548 int Rkind = 0; /* only for "d" - FIXME */
342 : maechler 1960 R_CheckStack();
343 : maechler 1375
344 : bates 1366 /* FIXME: currently drops dimnames */
345 : maechler 1960 return chm_sparse_to_SEXP(cholmod_vertcat(chx, chy, 1, &c),
346 :     1, 0, Rkind, "", R_NilValue);
347 : bates 1218 }
348 : bates 1265
349 :     SEXP Csparse_band(SEXP x, SEXP k1, SEXP k2)
350 :     {
351 : maechler 1960 CHM_SP chx = AS_CHM_SP(x);
352 : maechler 1736 int Rkind = (chx->xtype != CHOLMOD_PATTERN) ? Real_kind(x) : 0;
353 : maechler 1960 CHM_SP ans = cholmod_band(chx, asInteger(k1), asInteger(k2), chx->xtype, &c);
354 :     R_CheckStack();
355 : bates 1265
356 : maechler 1736 return chm_sparse_to_SEXP(ans, 1, 0, Rkind, "",
357 :     GET_SLOT(x, Matrix_DimNamesSym));
358 : bates 1265 }
359 : bates 1366
360 :     SEXP Csparse_diagU2N(SEXP x)
361 :     {
362 : maechler 2120 const char *cl = class_P(x);
363 :     /* dtCMatrix, etc; [1] = the second character =?= 't' for triangular */
364 :     if (cl[1] != 't' || *diag_P(x) != 'U') {
365 :     /* "trivially fast" when not triangular (<==> no 'diag' slot), or not *unit* triangular */
366 : maechler 1708 return (x);
367 :     }
368 :     else {
369 : maechler 1960 CHM_SP chx = AS_CHM_SP(x);
370 :     CHM_SP eye = cholmod_speye(chx->nrow, chx->ncol, chx->xtype, &c);
371 : maechler 1708 double one[] = {1, 0};
372 : maechler 1960 CHM_SP ans = cholmod_add(chx, eye, one, one, TRUE, TRUE, &c);
373 : maechler 1710 int uploT = (*uplo_P(x) == 'U') ? 1 : -1;
374 : maechler 1736 int Rkind = (chx->xtype != CHOLMOD_PATTERN) ? Real_kind(x) : 0;
375 : bates 1366
376 : maechler 1960 R_CheckStack();
377 :     cholmod_free_sparse(&eye, &c);
378 : maechler 1708 return chm_sparse_to_SEXP(ans, 1, uploT, Rkind, "N",
379 : maechler 1736 GET_SLOT(x, Matrix_DimNamesSym));
380 : maechler 1708 }
381 : bates 1366 }
382 :    
383 :     SEXP Csparse_submatrix(SEXP x, SEXP i, SEXP j)
384 :     {
385 : maechler 1960 CHM_SP chx = AS_CHM_SP(x);
386 : bates 1366 int rsize = (isNull(i)) ? -1 : LENGTH(i),
387 :     csize = (isNull(j)) ? -1 : LENGTH(j);
388 : maechler 1736 int Rkind = (chx->xtype != CHOLMOD_PATTERN) ? Real_kind(x) : 0;
389 : maechler 1960 R_CheckStack();
390 : bates 1366
391 :     if (rsize >= 0 && !isInteger(i))
392 :     error(_("Index i must be NULL or integer"));
393 :     if (csize >= 0 && !isInteger(j))
394 :     error(_("Index j must be NULL or integer"));
395 : maechler 1736
396 : bates 1366 return chm_sparse_to_SEXP(cholmod_submatrix(chx, INTEGER(i), rsize,
397 : maechler 1375 INTEGER(j), csize,
398 : bates 1366 TRUE, TRUE, &c),
399 : maechler 1736 1, 0, Rkind, "",
400 :     /* FIXME: drops dimnames */ R_NilValue);
401 : bates 1366 }
402 : bates 2049
403 :     SEXP Csparse_MatrixMarket(SEXP x, SEXP fname)
404 :     {
405 :     FILE *f = fopen(CHAR(asChar(fname)), "w");
406 :    
407 :     if (!f)
408 :     error(_("failure to open file \"%s\" for writing"),
409 :     CHAR(asChar(fname)));
410 : maechler 2120 if (!cholmod_write_sparse(f, AS_CHM_SP(Csparse_diagU2N(x)),
411 :     (CHM_SP)NULL, (char*) NULL, &c))
412 : bates 2049 error(_("cholmod_write_sparse returned error code"));
413 :     fclose(f);
414 :     return R_NilValue;
415 :     }

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