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[tm] Diff of /pkg/R/corpus.R
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Diff of /pkg/R/corpus.R

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revision 715, Wed Mar 14 15:16:27 2007 UTC revision 744, Mon Apr 23 00:35:10 2007 UTC
# Line 1  Line 1 
1  # Author: Ingo Feinerer  # Author: Ingo Feinerer
2    
3  # The "..." are additional arguments for the FunctionGenerator parser  # The "..." are additional arguments for the FunctionGenerator reader
4  setGeneric("TextDocCol", function(object,  setGeneric("TextDocCol", function(object,
5                                    parser = readPlain,                                    readerControl = list(reader = object@DefaultReader, language = "en_US", load = FALSE),
                                   load = FALSE,  
6                                    dbControl = list(useDb = FALSE, dbName = "", dbType = "DB1"),                                    dbControl = list(useDb = FALSE, dbName = "", dbType = "DB1"),
7                                    ...) standardGeneric("TextDocCol"))                                    ...) standardGeneric("TextDocCol"))
8  setMethod("TextDocCol",  setMethod("TextDocCol",
9            signature(object = "Source"),            signature(object = "Source"),
10            function(object, parser = readPlain, load = FALSE, dbControl = list(useDb = FALSE, dbName = "", dbType = "DB1"), ...) {            function(object,
11                if (inherits(parser, "FunctionGenerator"))                     readerControl = list(reader = object@DefaultReader, language = "en_US", load = FALSE),
12                    parser <- parser(...)                     dbControl = list(useDb = FALSE, dbName = "", dbType = "DB1"),
13                       ...) {
14                  if (attr(readerControl$reader, "FunctionGenerator"))
15                      readerControl$reader <- readerControl$reader(...)
16    
17                if (dbControl$useDb) {                if (dbControl$useDb) {
18                    if (!dbCreate(dbControl$dbName, dbControl$dbType))                    if (!dbCreate(dbControl$dbName, dbControl$dbType))
# Line 26  Line 28 
28                    # If there is no Load on Demand support                    # If there is no Load on Demand support
29                    # we need to load the corpus into memory at startup                    # we need to load the corpus into memory at startup
30                    if (!object@LoDSupport)                    if (!object@LoDSupport)
31                        load <- TRUE                        readerControl$load <- TRUE
32                    doc <- parser(elem, load, as.character(counter))                    doc <- readerControl$reader(elem, readerControl$load, readerControl$language, as.character(counter))
33                    if (dbControl$useDb) {                    if (dbControl$useDb) {
34                        dbInsert(db, ID(doc), doc)                        dbInsert(db, ID(doc), doc)
35                        tdl <- c(tdl, ID(doc))                        tdl <- c(tdl, ID(doc))
# Line 40  Line 42 
42                df <- data.frame(MetaID = rep(0, length(tdl)), stringsAsFactors = FALSE)                df <- data.frame(MetaID = rep(0, length(tdl)), stringsAsFactors = FALSE)
43                if (dbControl$useDb) {                if (dbControl$useDb) {
44                    dbInsert(db, "DMetaData", df)                    dbInsert(db, "DMetaData", df)
45                    dmeta.df <- data.frame(key = "DMetaData")                    dmeta.df <- data.frame(key = "DMetaData", subset = I(list(NA)))
46                    dbDisconnect(db)                    dbDisconnect(db)
47                }                }
48                else                else
# Line 93  Line 95 
95                    mail <- readLines(con)                    mail <- readLines(con)
96                    close(con)                    close(con)
97                    Cached(object) <- TRUE                    Cached(object) <- TRUE
98                    for (index in seq(along = mail)) {                    for (index in seq_along(mail)) {
99                        if (mail[index] == "")                        if (mail[index] == "")
100                            break                            break
101                    }                    }
# Line 104  Line 106 
106                }                }
107            })            })
108    
109  setGeneric("tmUpdate", function(object, origin, parser = readPlain, ...) standardGeneric("tmUpdate"))  setGeneric("tmUpdate", function(object,
110                                    origin,
111                                    readerControl = list(reader = origin@DefaultReader, language = "en_US", load = FALSE),
112                                    ...) standardGeneric("tmUpdate"))
113  # Update is only supported for directories  # Update is only supported for directories
114  # At the moment no other LoD devices are available anyway  # At the moment no other LoD devices are available anyway
115  setMethod("tmUpdate",  setMethod("tmUpdate",
116            signature(object = "TextDocCol", origin = "DirSource"),            signature(object = "TextDocCol", origin = "DirSource"),
117            function(object, origin, parser = readPlain, load = FALSE, ...) {            function(object, origin,
118                if (inherits(parser, "FunctionGenerator"))                     readerControl = list(reader = origin@DefaultReader, language = "en_US", load = FALSE),
119                    parser <- parser(...)                     ...) {
120                  if (inherits(readerControl$reader, "FunctionGenerator"))
121                      readerControl$reader <- readerControl$reader(...)
122    
123                object.filelist <- unlist(lapply(object, function(x) {as.character(URI(x))[2]}))                object.filelist <- unlist(lapply(object, function(x) {as.character(URI(x))[2]}))
124                new.files <- setdiff(origin@FileList, object.filelist)                new.files <- setdiff(origin@FileList, object.filelist)
# Line 119  Line 126 
126                for (filename in new.files) {                for (filename in new.files) {
127                    elem <- list(content = readLines(filename),                    elem <- list(content = readLines(filename),
128                                 uri = substitute(file(filename)))                                 uri = substitute(file(filename)))
129                    object <- appendElem(object, parser(elem, load, filename))                    object <- appendElem(object, readerControl$reader(elem, readerControl$load, readerControl$language, filename))
130                }                }
131    
132                return(object)                return(object)
# Line 131  Line 138 
138            function(object, FUN, ...) {            function(object, FUN, ...) {
139                result <- object                result <- object
140                # Note that text corpora are automatically loaded into memory via \code{[[}                # Note that text corpora are automatically loaded into memory via \code{[[}
141                  if (DBControl(object)[["useDb"]]) {
142                      db <- dbInit(DBControl(object)[["dbName"]], DBControl(object)[["dbType"]])
143                      i <- 1
144                      for (id in unlist(object)) {
145                          db[[id]] <- FUN(object[[i]], ..., DMetaData = DMetaData(object))
146                          i <- i + 1
147                      }
148                      dbDisconnect(db)
149                  }
150                  else
151                result@.Data <- lapply(object, FUN, ..., DMetaData = DMetaData(object))                result@.Data <- lapply(object, FUN, ..., DMetaData = DMetaData(object))
152                return(result)                return(result)
153            })            })
# Line 152  Line 169 
169    
170                return(FUN(xmlRoot(corpus), ...))                return(FUN(xmlRoot(corpus), ...))
171            })            })
172    setMethod("asPlain",
173              signature(object = "NewsgroupDocument"),
174              function(object, FUN, ...) {
175                  new("PlainTextDocument", .Data = Corpus(object), Cached = TRUE, URI = "", Author = Author(object),
176                      DateTimeStamp = DateTimeStamp(object), Description = Description(object), ID = ID(object),
177                      Origin = Origin(object), Heading = Heading(object), Language = Language(object))
178              })
179    
180  setGeneric("tmTolower", function(object, ...) standardGeneric("tmTolower"))  setGeneric("tmTolower", function(object, ...) standardGeneric("tmTolower"))
181  setMethod("tmTolower",  setMethod("tmTolower",
# Line 182  Line 206 
206                return(object)                return(object)
207            })            })
208    
209    setGeneric("removePunctuation", function(object, ...) standardGeneric("removePunctuation"))
210    setMethod("removePunctuation",
211              signature(object = "PlainTextDocument"),
212              function(object, ...) {
213                  Corpus(object) <- gsub("[[:punct:]]+", "", Corpus(object))
214                  return(object)
215              })
216    
217  setGeneric("removeWords", function(object, stopwords, ...) standardGeneric("removeWords"))  setGeneric("removeWords", function(object, stopwords, ...) standardGeneric("removeWords"))
218  setMethod("removeWords",  setMethod("removeWords",
219            signature(object = "PlainTextDocument", stopwords = "character"),            signature(object = "PlainTextDocument", stopwords = "character"),
# Line 199  Line 231 
231                if (doclevel)                if (doclevel)
232                    return(object[sapply(object, FUN, ..., DMetaData = DMetaData(object))])                    return(object[sapply(object, FUN, ..., DMetaData = DMetaData(object))])
233                else                else
234                    return(object[FUN(object, ...)]) # TODO: Check that FUN knows about the database                    return(object[FUN(object, ...)])
235            })            })
236    
237  setGeneric("tmIndex", function(object, ..., FUN = sFilter, doclevel = FALSE) standardGeneric("tmIndex"))  setGeneric("tmIndex", function(object, ..., FUN = sFilter, doclevel = FALSE) standardGeneric("tmIndex"))
# Line 209  Line 241 
241                if (doclevel)                if (doclevel)
242                    return(sapply(object, FUN, ..., DMetaData = DMetaData(object)))                    return(sapply(object, FUN, ..., DMetaData = DMetaData(object)))
243                else                else
244                    return(FUN(object, ...)) # TODO: Check that FUN knows about the database                    return(FUN(object, ...))
245            })            })
246    
 # TODO  
247  sFilter <- function(object, s, ...) {  sFilter <- function(object, s, ...) {
     query.df <- DMetaData(object)  
248      con <- textConnection(s)      con <- textConnection(s)
249      tokens <- scan(con, "character")      tokens <- scan(con, "character")
250      close(con)      close(con)
251      local.meta <- lapply(object, LocalMetaData)      localMetaNames <- unique(names(sapply(object, LocalMetaData)))
252      local.used.meta <- lapply(local.meta, function(x) names(x) %in% tokens)      localMetaTokens <- localMetaNames[localMetaNames %in% tokens]
253      l.meta <- NULL      n <- names(DMetaData(object))
254      for (i in 1:length(object)) {      tags <- c("Author", "DateTimeStamp", "Description", "ID", "Origin", "Heading", "Language", localMetaTokens)
255          l.meta <- c(l.meta, list(local.meta[[i]][local.used.meta[[i]]]))      query.df <- DMetaData(prescindMeta(object, tags))
256      }      if (DBControl(object)[["useDb"]])
257      # Load local meta data from text documents into data frame          DMetaData(object) <- DMetaData(object)[, setdiff(n, tags), drop = FALSE]
258      for (i in 1:length(l.meta)) {      # Rename to avoid name conflicts
259          l.meta[[i]] <- c(l.meta[[i]], list(author = Author(object[[i]])))      names(query.df)[names(query.df) == "Author"] <- "author"
260          l.meta[[i]] <- c(l.meta[[i]], list(datetimestamp = DateTimeStamp(object[[i]])))      names(query.df)[names(query.df) == "DateTimeStamp"] <- "datetimestamp"
261          l.meta[[i]] <- c(l.meta[[i]], list(description = Description(object[[i]])))      names(query.df)[names(query.df) == "Description"] <- "description"
262          l.meta[[i]] <- c(l.meta[[i]], list(identifier = ID(object[[i]])))      names(query.df)[names(query.df) == "ID"] <- "identifier"
263          l.meta[[i]] <- c(l.meta[[i]], list(origin = Origin(object[[i]])))      names(query.df)[names(query.df) == "Origin"] <- "origin"
264          l.meta[[i]] <- c(l.meta[[i]], list(heading = Heading(object[[i]])))      names(query.df)[names(query.df) == "Heading"] <- "heading"
265      }      names(query.df)[names(query.df) == "Language"] <- "language"
     for (i in 1:length(l.meta)) {  
         for (j in 1:length(l.meta[[i]])) {  
             m <- l.meta[[i]][[j]]  
             m.name <- names(l.meta[[i]][j])  
             if (!(m.name %in% names(query.df))) {  
                 before <- rep(NA, i - 1)  
                 after <- rep(NA, length(l.meta) - i)  
                 if (length(m) > 1) {  
                     nl <- vector("list", length(l.meta))  
                     nl[1:(i-1)] <- before  
                     nl[i] <- list(m)  
                     nl[(i+1):length(l.meta)] <- after  
                     insert <- data.frame(I(nl), stringsAsFactors = FALSE)  
                 }  
                 else  
                     insert <- c(before, m, after)  
                 query.df <- cbind(query.df, insert, stringsAsFactors = FALSE)  
                 names(query.df)[length(query.df)] <- m.name  
             }  
             else {  
                 if (is.null(m))  
                     m <- NA  
                 if (length(m) > 1) {  
                     rl <- query.df[ , m.name]  
                     rl[i] <- list(m)  
                     query.df[ , m.name] <- data.frame(I(rl), stringsAsFactors = FALSE)  
                 }  
                 else  
                     query.df[i, m.name] <- m  
             }  
         }  
     }  
266      attach(query.df)      attach(query.df)
267      try(result <- rownames(query.df) %in% row.names(query.df[eval(parse(text = s)), ]))      try(result <- rownames(query.df) %in% row.names(query.df[eval(parse(text = s)), ]))
268      detach(query.df)      detach(query.df)
# Line 302  Line 300 
300            function(object, cmeta = NULL, dmeta = NULL) {            function(object, cmeta = NULL, dmeta = NULL) {
301                object@CMetaData@MetaData <- c(CMetaData(object)@MetaData, cmeta)                object@CMetaData@MetaData <- c(CMetaData(object)@MetaData, cmeta)
302                if (!is.null(dmeta)) {                if (!is.null(dmeta)) {
303                    DMetaData(object) <- cbind(DMetaData(object), dmeta)                    DMetaData(object) <- cbind(DMetaData(object), eval(dmeta))
304                }                }
305                return(object)                return(object)
306            })            })
# Line 311  Line 309 
309  setMethod("removeMeta",  setMethod("removeMeta",
310            signature(object = "TextDocCol"),            signature(object = "TextDocCol"),
311            function(object, cname = NULL, dname = NULL) {            function(object, cname = NULL, dname = NULL) {
312                if (!is.null(cname)) {                if (!is.null(cname))
313                    object@CMetaData@MetaData <- CMetaData(object)@MetaData[names(CMetaData(object)@MetaData) != cname]                    object@CMetaData@MetaData <- CMetaData(object)@MetaData[names(CMetaData(object)@MetaData) != cname]
314                }                if (!is.null(dname))
315                if (!is.null(dname)) {                    DMetaData(object) <- DMetaData(object)[, names(DMetaData(object)) != dname, drop = FALSE]
                   DMetaData(object) <- DMetaData(object)[names(DMetaData(object)) != dname]  
               }  
316                return(object)                return(object)
317            })            })
318    
 # TODO  
319  setGeneric("prescindMeta", function(object, meta) standardGeneric("prescindMeta"))  setGeneric("prescindMeta", function(object, meta) standardGeneric("prescindMeta"))
320  setMethod("prescindMeta",  setMethod("prescindMeta",
321            signature(object = "TextDocCol", meta = "character"),            signature(object = "TextDocCol", meta = "character"),
322            function(object, meta) {            function(object, meta) {
323                for (m in meta) {                for (m in meta) {
324                    if (m %in% c("Author", "DateTimeStamp", "Description", "ID", "Origin", "Heading")) {                    if (m %in% c("Author", "DateTimeStamp", "Description", "ID", "Origin", "Heading", "Language")) {
325                        local.m <- lapply(object, m)                        local.m <- lapply(object, m)
326                        local.m <- lapply(local.m, function(x) if (is.null(x)) return(NA) else return(x))                        local.m <- lapply(local.m, function(x) if (is.null(x)) return(NA) else return(x))
327                        local.m <- unlist(local.m)                        local.m <- unlist(local.m)
328                        object@DMetaData <- cbind(DMetaData(object), data.frame(m = local.m), stringsAsFactors = FALSE)                        DMetaData(object) <- cbind(DMetaData(object), data.frame(m = local.m, stringsAsFactors = FALSE))
329                        names(object@DMetaData)[length(object@DMetaData)] <- m                        names(DMetaData(object))[which(names(DMetaData(object)) == "m")] <- m
330                    }                    }
331                    else {                    else {
332                        local.meta <- lapply(object, LocalMetaData)                        local.meta <- lapply(object, LocalMetaData)
# Line 341  Line 336 
336                            local.m <- unlist(local.m)                            local.m <- unlist(local.m)
337                        else                        else
338                            local.m <- I(local.m)                            local.m <- I(local.m)
339                        object@DMetaData <- cbind(DMetaData(object), data.frame(m = local.m), stringsAsFactors = FALSE)                        DMetaData(object) <- cbind(DMetaData(object), data.frame(m = local.m, stringsAsFactors = FALSE))
340                        names(object@DMetaData)[length(object@DMetaData)] <- m                        names(DMetaData(object))[which(names(DMetaData(object)) == "m")] <- m
341                    }                    }
342                }                }
343                return(object)                return(object)
344            })            })
345    
 # WARNING: DMetaData is changed (since both use the same database)  
346  setMethod("[",  setMethod("[",
347            signature(x = "TextDocCol", i = "ANY", j = "ANY", drop = "ANY"),            signature(x = "TextDocCol", i = "ANY", j = "ANY", drop = "ANY"),
348            function(x, i, j, ... , drop) {            function(x, i, j, ... , drop) {
# Line 357  Line 351 
351    
352                object <- x                object <- x
353                object@.Data <- x@.Data[i, ..., drop = FALSE]                object@.Data <- x@.Data[i, ..., drop = FALSE]
354                df <- as.data.frame(DMetaData(x)[i, ])                if (DBControl(object)[["useDb"]]) {
355                names(df) <- names(DMetaData(x))                    index <- object@DMetaData[[1 , "subset"]]
356                DMetaData(object) <- df                    if (any(is.na(index)))
357                          object@DMetaData[[1 , "subset"]] <- i
358                      else
359                          object@DMetaData[[1 , "subset"]] <- index[i]
360                  }
361                  else
362                      DMetaData(object) <- DMetaData(x)[i, , drop = FALSE]
363                return(object)                return(object)
364            })            })
365    
 # TODO  
366  setMethod("[<-",  setMethod("[<-",
367            signature(x = "TextDocCol", i = "ANY", j = "ANY", value = "ANY"),            signature(x = "TextDocCol", i = "ANY", j = "ANY", value = "ANY"),
368            function(x, i, j, ... , value) {            function(x, i, j, ... , value) {
369                object <- x                object <- x
370                  if (DBControl(object)[["useDb"]]) {
371                      db <- dbInit(DBControl(object)[["dbName"]], DBControl(object)[["dbType"]])
372                      counter <- 1
373                      for (id in object@.Data[i, ...]) {
374                          if (length(value) == 1)
375                              db[[id]] <- value
376                          else {
377                              db[[id]] <- value[[counter]]
378                          }
379                          counter <- counter + 1
380                      }
381                      dbDisconnect(db)
382                  }
383                  else
384                object@.Data[i, ...] <- value                object@.Data[i, ...] <- value
385                return(object)                return(object)
386            })            })
# Line 400  Line 413 
413                return(object)                return(object)
414            })            })
415    
 # TODO  
416  # Update \code{NodeID}s of a CMetaData tree  # Update \code{NodeID}s of a CMetaData tree
417  update_id <- function(object, id = 0, mapping = NULL, left.mapping = NULL, level = 0) {  update_id <- function(object, id = 0, mapping = NULL, left.mapping = NULL, level = 0) {
418      # Traversal of (binary) CMetaData tree with setup of \code{NodeID}s      # Traversal of (binary) CMetaData tree with setup of \code{NodeID}s
# Line 429  Line 441 
441      return(list(root = set_id(object), left.mapping = left.mapping, right.mapping = mapping))      return(list(root = set_id(object), left.mapping = left.mapping, right.mapping = mapping))
442  }  }
443    
 # TODO  
444  setMethod("c",  setMethod("c",
445            signature(x = "TextDocCol"),            signature(x = "TextDocCol"),
446            function(x, ..., meta = list(merge_date = Sys.time(), merger = Sys.getenv("LOGNAME")), recursive = TRUE) {            function(x, ..., meta = list(merge_date = Sys.time(), merger = Sys.getenv("LOGNAME")), recursive = TRUE) {
# Line 437  Line 448 
448                if(length(args) == 0)                if(length(args) == 0)
449                    return(x)                    return(x)
450    
451                  if (!all(sapply(args, inherits, "TextDocCol")))
452                      stop("not all arguments are text document collections")
453                  if (DBControl(x)[["useDb"]] == TRUE || any(unlist(sapply(args, DBControl)["useDb", ])))
454                      stop("concatenating text document collections with activated database is not supported")
455    
456                result <- x                result <- x
457                for (c in args) {                for (c in args) {
                   if (!inherits(c, "TextDocCol"))  
                       stop("invalid argument")  
458                    result <- c2(result, c)                    result <- c2(result, c)
459                }                }
460                return(result)                return(result)
461            })            })
462    
 # TODO  
463  setGeneric("c2", function(x, y, ..., meta = list(merge_date = Sys.time(), merger = Sys.getenv("LOGNAME")), recursive = TRUE) standardGeneric("c2"))  setGeneric("c2", function(x, y, ..., meta = list(merge_date = Sys.time(), merger = Sys.getenv("LOGNAME")), recursive = TRUE) standardGeneric("c2"))
464  setMethod("c2",  setMethod("c2",
465            signature(x = "TextDocCol", y = "TextDocCol"),            signature(x = "TextDocCol", y = "TextDocCol"),
# Line 455  Line 468 
468                # Concatenate data slots                # Concatenate data slots
469                object@.Data <- c(as(x, "list"), as(y, "list"))                object@.Data <- c(as(x, "list"), as(y, "list"))
470    
471                  # Set the DBControl slot
472                  object@DBControl <- list(useDb = FALSE, dbName = "", dbType = "DB1")
473    
474                # Update the CMetaData tree                # Update the CMetaData tree
475                cmeta <- new("MetaDataNode", NodeID = 0, MetaData = meta, children = list(CMetaData(x), CMetaData(y)))                cmeta <- new("MetaDataNode", NodeID = 0, MetaData = meta, children = list(CMetaData(x), CMetaData(y)))
476                update.struct <- update_id(cmeta)                update.struct <- update_id(cmeta)
# Line 500  Line 516 
516                return(object)                return(object)
517            })            })
518    
 # TODO  
519  setMethod("c",  setMethod("c",
520            signature(x = "TextDocument"),            signature(x = "TextDocument"),
521            function(x, ..., recursive = TRUE){            function(x, ..., recursive = TRUE){
# Line 514  Line 529 
529                              MetaData = list(create_date = Sys.time(), creator = Sys.getenv("LOGNAME")),                              MetaData = list(create_date = Sys.time(), creator = Sys.getenv("LOGNAME")),
530                              children = list())                              children = list())
531    
532                return(new("TextDocCol", .Data = list(x, ...), DMetaData = dmeta.df, CMetaData = cmeta.node))                return(new("TextDocCol",
533                             .Data = list(x, ...),
534                             DMetaData = dmeta.df,
535                             CMetaData = cmeta.node,
536                             DBControl = list(useDb = FALSE, dbName = "", dbType = "DB1")))
537            })            })
538    
539  setMethod("length",  setMethod("length",
# Line 542  Line 561 
561                                                "\nThe metadata consists of %d tag-value pairs and a data frame\n"),                                                "\nThe metadata consists of %d tag-value pairs and a data frame\n"),
562                                         length(CMetaData(object)@MetaData)))                                         length(CMetaData(object)@MetaData)))
563                    cat("Available tags are:\n")                    cat("Available tags are:\n")
564                    cat(names(CMetaData(object)@MetaData), "\n")                    cat(strwrap(paste(names(CMetaData(object)@MetaData), collapse = " "), indent = 2, exdent = 2), "\n")
565                    cat("Available variables in the data frame are:\n")                    cat("Available variables in the data frame are:\n")
566                    cat(names(DMetaData(object)), "\n")                    cat(strwrap(paste(names(DMetaData(object)), collapse = " "), indent = 2, exdent = 2), "\n")
567                }                }
568      })      })
569    
 # TODO  
570  setGeneric("inspect", function(object) standardGeneric("inspect"))  setGeneric("inspect", function(object) standardGeneric("inspect"))
571  setMethod("inspect",  setMethod("inspect",
572            signature("TextDocCol"),            signature("TextDocCol"),
573            function(object) {            function(object) {
574                summary(object)                summary(object)
575                cat("\n")                cat("\n")
576                  if (DBControl(object)[["useDb"]]) {
577                      db <- dbInit(DBControl(object)[["dbName"]], DBControl(object)[["dbType"]])
578                      show(dbMultiFetch(db, unlist(object)))
579                      dbDisconnect(db)
580                  }
581                  else
582                show(object@.Data)                show(object@.Data)
583            })            })
584    
 # TODO  
585  # No metadata is checked  # No metadata is checked
586  setGeneric("%IN%", function(x, y) standardGeneric("%IN%"))  setGeneric("%IN%", function(x, y) standardGeneric("%IN%"))
587  setMethod("%IN%",  setMethod("%IN%",
588            signature(x = "TextDocument", y = "TextDocCol"),            signature(x = "TextDocument", y = "TextDocCol"),
589            function(x, y) {            function(x, y) {
590                x %in% y                if (DBControl(y)[["useDb"]]) {
591                      db <- dbInit(DBControl(y)[["dbName"]], DBControl(y)[["dbType"]])
592                      result <- any(sapply(y, function(x, z) {x %in% Corpus(z)}, x))
593                      dbDisconnect(db)
594                  }
595                  else
596                      result <- x %in% y
597                  return(result)
598              })
599    
600    setMethod("lapply",
601              signature(X = "TextDocCol"),
602              function(X, FUN, ...) {
603                  if (DBControl(X)[["useDb"]]) {
604                      db <- dbInit(DBControl(X)[["dbName"]], DBControl(X)[["dbType"]])
605                      result <- lapply(dbMultiFetch(db, unlist(X)), FUN, ...)
606                      dbDisconnect(db)
607                  }
608                  else
609                      result <- base::lapply(X, FUN, ...)
610                  return(result)
611              })
612    
613    setMethod("sapply",
614              signature(X = "TextDocCol"),
615              function(X, FUN, ..., simplify = TRUE, USE.NAMES = TRUE) {
616                  if (DBControl(X)[["useDb"]]) {
617                      db <- dbInit(DBControl(X)[["dbName"]], DBControl(X)[["dbType"]])
618                      result <- sapply(dbMultiFetch(db, unlist(X)), FUN, ...)
619                      dbDisconnect(db)
620                  }
621                  else
622                      result <- base::sapply(X, FUN, ...)
623                  return(result)
624            })            })

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