SCM

SCM Repository

[tm] Diff of /pkg/R/corpus.R
ViewVC logotype

Diff of /pkg/R/corpus.R

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

trunk/R/textmin/R/textdoccol.R revision 70, Tue Nov 7 18:18:51 2006 UTC pkg/R/corpus.R revision 1409, Fri Feb 27 16:10:18 2015 UTC
# Line 1  Line 1 
1  # Author: Ingo Feinerer  # Author: Ingo Feinerer
2    
3  # The "..." are additional arguments for the function_generator parser  PCorpus <-
4  setGeneric("TextDocCol", function(object, parser = plaintext_parser, ...) standardGeneric("TextDocCol"))  function(x,
5  setMethod("TextDocCol",           readerControl = list(reader = reader(x), language = "en"),
6            signature(object = "Source"),           dbControl = list(dbName = "", dbType = "DB1"))
7            function(object, parser = plaintext_parser, ...) {  {
8                if (inherits(parser, "function_generator"))      stopifnot(inherits(x, "Source"))
9                    parser <- parser(...)  
10        readerControl <- prepareReader(readerControl, reader(x))
11    
12        if (!filehash::dbCreate(dbControl$dbName, dbControl$dbType))
13            stop("error in creating database")
14        db <- filehash::dbInit(dbControl$dbName, dbControl$dbType)
15    
16                tdl <- list()      x <- open(x)
17        tdl <- vector("list", length(x))
18                counter <- 1                counter <- 1
19                while (!eoi(object)) {      while (!eoi(x)) {
20                    object <- step_next(object)          x <- stepNext(x)
21                    elem <- get_elem(object)          elem <- getElem(x)
22                    # If there is no Load on Demand support          doc <- readerControl$reader(elem,
23                    # we need to load the corpus into memory at startup                                      readerControl$language,
24                    if (object@LoDSupport)                                      as.character(counter))
25                        load <- object@Load          filehash::dbInsert(db, meta(doc, "id"), doc)
26                    else          tdl[[counter]] <- meta(doc, "id")
                       load <- TRUE  
                   tdl <- c(tdl, list(parser(elem, object@LoDSupport, load, as.character(counter))))  
27                    counter <- counter + 1                    counter <- counter + 1
28                }                }
29        x <- close(x)
30    
31                return(new("TextDocCol", .Data = tdl))      p <- list(content = tdl,
32            })                meta = CorpusMeta(),
33                  dmeta = data.frame(row.names = seq_along(tdl)),
34  setGeneric("DirSource", function(directory, load = FALSE) standardGeneric("DirSource"))                dbcontrol = dbControl)
35  setMethod("DirSource",      class(p) <- c("PCorpus", "Corpus")
36            signature(directory = "character"),      p
37            function(directory, load = FALSE) {  }
38                new("DirSource", LoDSupport = TRUE, FileList = dir(directory, full.names = TRUE),  
39                    Position = 0, Load = load)  Corpus <-
40            })  VCorpus <-
41    function(x, readerControl = list(reader = reader(x), language = "en"))
42  setGeneric("CSVSource", function(object) standardGeneric("CSVSource"))  {
43  setMethod("CSVSource",      stopifnot(inherits(x, "Source"))
44            signature(object = "character"),  
45            function(object) {      readerControl <- prepareReader(readerControl, reader(x))
46                object <- substitute(file(object))  
47                con <- eval(object)      x <- open(x)
48                content <- scan(con, what = "character")      tdl <- vector("list", length(x))
49                close(con)      # Check for parallel element access
50                new("CSVSource", LoDSupport = FALSE, URI = object,      if (is.function(getS3method("pGetElem", class(x), TRUE)))
51                    Content = content, Position = 0)          tdl <- mapply(function(elem, id)
52            })                            readerControl$reader(elem, readerControl$language, id),
53  setMethod("CSVSource",                        pGetElem(x),
54            signature(object = "ANY"),                        id = as.character(seq_along(x)),
55            function(object) {                        SIMPLIFY = FALSE)
               object <- substitute(object)  
               con <- eval(object)  
               content <- scan(con, what = "character")  
               close(con)  
               new("CSVSource", LoDSupport = FALSE, URI = object,  
                   Content = content, Position = 0)  
           })  
   
 setGeneric("ReutersSource", function(object) standardGeneric("ReutersSource"))  
 setMethod("ReutersSource",  
           signature(object = "character"),  
           function(object) {  
               object <- substitute(file(object))  
               con <- eval(object)  
               corpus <- paste(readLines(con), "\n", collapse = "")  
               close(con)  
               tree <- xmlTreeParse(corpus, asText = TRUE)  
               content <- xmlRoot(tree)$children  
   
               new("ReutersSource", LoDSupport = FALSE, URI = object,  
                   Content = content, Position = 0)  
           })  
 setMethod("ReutersSource",  
           signature(object = "ANY"),  
           function(object) {  
               object <- substitute(object)  
               con <- eval(object)  
               corpus <- paste(readLines(con), "\n", collapse = "")  
               close(con)  
               tree <- xmlTreeParse(corpus, asText = TRUE)  
               content <- xmlRoot(tree)$children  
   
               new("ReutersSource", LoDSupport = FALSE, URI = object,  
                   Content = content, Position = 0)  
           })  
   
 setGeneric("step_next", function(object) standardGeneric("step_next"))  
 setMethod("step_next",  
           signature(object = "DirSource"),  
           function(object) {  
               object@Position <- object@Position + 1  
               object  
           })  
 setMethod("step_next",  
           signature(object = "CSVSource"),  
           function(object) {  
               object@Position <- object@Position + 1  
               object  
           })  
 setMethod("step_next",  
           signature(object = "ReutersSource"),  
           function(object) {  
               object@Position <- object@Position + 1  
               object  
           })  
   
 setGeneric("get_elem", function(object) standardGeneric("get_elem"))  
 setMethod("get_elem",  
           signature(object = "DirSource"),  
           function(object) {  
               filename <- object@FileList[object@Position]  
               list(content = readLines(object@FileList[object@Position]),  
                    uri = substitute(file(filename)))  
           })  
 setMethod("get_elem",  
           signature(object = "CSVSource"),  
           function(object) {  
               list(content = object@Content[object@Position],  
                    uri = object@URI)  
           })  
 setMethod("get_elem",  
           signature(object = "ReutersSource"),  
           function(object) {  
               # Construct a character representation from the XMLNode  
               con <- textConnection("virtual.file", "w")  
               saveXML(object@Content[[object@Position]], con)  
               close(con)  
   
               list(content = virtual.file, uri = object@URI)  
           })  
   
 setGeneric("eoi", function(object) standardGeneric("eoi"))  
 setMethod("eoi",  
           signature(object = "DirSource"),  
           function(object) {  
               if (length(object@FileList) <= object@Position)  
                   return(TRUE)  
               else  
                   return(FALSE)  
           })  
 setMethod("eoi",  
           signature(object = "CSVSource"),  
           function(object) {  
               if (length(object@Content) <= object@Position)  
                   return(TRUE)  
               else  
                   return(FALSE)  
           })  
 setMethod("eoi",  
           signature(object = "ReutersSource"),  
           function(object) {  
               if (length(object@Content) <= object@Position)  
                   return(TRUE)  
               else  
                   return(FALSE)  
           })  
   
 plaintext_parser <- function(...) {  
     function(elem, lodsupport, load, id) {  
         if (!lodsupport || (lodsupport && load)) {  
             doc <- new("PlainTextDocument", .Data = elem$content, URI = elem$uri, Cached = TRUE,  
                        Author = "", DateTimeStamp = date(), Description = "", ID = id, Origin = "", Heading = "")  
         }  
56          else {          else {
57              doc <- new("PlainTextDocument", URI = elem$uri, Cached = FALSE,          counter <- 1
58                         Author = "", DateTimeStamp = date(), Description = "", ID = id, Origin = "", Heading = "")          while (!eoi(x)) {
59          }              x <- stepNext(x)
60                elem <- getElem(x)
61          return(doc)              doc <- readerControl$reader(elem,
62                                            readerControl$language,
63                                            as.character(counter))
64                tdl[[counter]] <- doc
65                counter <- counter + 1
66      }      }
67  }  }
68  class(plaintext_parser) <- "function_generator"      x <- close(x)
   
 reut21578xml_parser <- function(...) {  
     function(elem, lodsupport, load, id) {  
         corpus <- paste(elem$content, "\n", collapse = "")  
         tree <- xmlTreeParse(corpus, asText = TRUE)  
         node <- xmlRoot(tree)  
69    
70          # Mask as list to bypass S4 checks      as.VCorpus(tdl)
         class(tree) <- "list"  
   
         # The <AUTHOR></AUTHOR> tag is unfortunately NOT obligatory!  
         if (!is.null(node[["TEXT"]][["AUTHOR"]]))  
             author <- xmlValue(node[["TEXT"]][["AUTHOR"]])  
         else  
             author <- ""  
   
         datetimestamp <- xmlValue(node[["DATE"]])  
         description <- ""  
         id <- xmlAttrs(node)[["NEWID"]]  
   
         # The <TITLE></TITLE> tag is unfortunately NOT obligatory!  
         if (!is.null(node[["TEXT"]][["TITLE"]]))  
             heading <- xmlValue(node[["TEXT"]][["TITLE"]])  
         else  
             heading <- ""  
   
         topics <- unlist(xmlApply(node[["TOPICS"]], function(x) xmlValue(x)), use.names = FALSE)  
   
         if (!lodsupport || (lodsupport && load)) {  
             doc <- new("XMLTextDocument", .Data = tree, URI = elem$uri, Cached = TRUE, Author = author,  
                        DateTimeStamp = datetimestamp, Description = "", ID = id, Origin = "Reuters-21578 XML",  
                        Heading = heading, LocalMetaData = list(Topics = topics))  
         } else {  
             doc <- new("XMLTextDocument", URI = elem$uri, Cached = FALSE, Author = author,  
                        DateTimeStamp = datetimestamp, Description = "", ID = id, Origin = "Reuters-21578 XML",  
                        Heading = heading, LocalMetaData = list(Topics = topics))  
71          }          }
72    
73          return(doc)  `[.PCorpus` <-
74    function(x, i)
75    {
76        if (!missing(i)) {
77            x$content <- x$content[i]
78            x$dmeta <- x$dmeta[i, , drop = FALSE]
79      }      }
80  }      x
 class(reut21578xml_parser) <- "function_generator"  
   
 rcv1_parser <- function(...) {  
     function(elem, lodsupport, load, id) {  
         corpus <- paste(elem$content, "\n", collapse = "")  
         tree <- xmlTreeParse(corpus, asText = TRUE)  
         node <- xmlRoot(tree)  
   
         # Mask as list to bypass S4 checks  
         class(tree) <- "list"  
   
         datetimestamp <- xmlAttrs(node)[["date"]]  
         id <- xmlAttrs(node)[["itemid"]]  
         heading <- xmlValue(node[["title"]])  
   
         if (!lodsupport || (lodsupport && load)) {  
             doc <- new("XMLTextDocument", .Data = tree, URI = elem$uri, Cached = TRUE, Author = "",  
                        DateTimeStamp = datetimestamp, Description = "", ID = id, Origin = "Reuters Corpus Volume 1 XML",  
                        Heading = heading)  
         } else {  
             doc <- new("XMLTextDocument", URI = elem$uri, Cached = FALSE, Author = "",  
                        DateTimeStamp = datetimestamp, Description = "", ID = id, Origin = "Reuters Corpus Volume 1 XML",  
                        Heading = heading)  
81          }          }
82    
83          return(doc)  `[.VCorpus` <-
84    function(x, i)
85    {
86        if (!missing(i)) {
87            x$content <- x$content[i]
88            x$dmeta <- x$dmeta[i, , drop = FALSE]
89            if (!is.null(x$lazy))
90                x$lazy$index <- x$lazy$index[i]
91      }      }
92        x
93  }  }
 class(rcv1_parser) <- "function_generator"  
94    
95  newsgroup_parser <- function(...) {  .map_name_index <-
96      function(elem, lodsupport, load, id) {  function(x, i)
97          mail <- elem$content  {
98          author <- gsub("From: ", "", grep("^From:", mail, value = TRUE))      if (is.character(i))
99          datetimestamp <- gsub("Date: ", "", grep("^Date:", mail, value = TRUE))          match(i, meta(x, "id", "local"))
100          origin <- gsub("Path: ", "", grep("^Path:", mail, value = TRUE))      else
101          heading <- gsub("Subject: ", "", grep("^Subject:", mail, value = TRUE))          i
         newsgroup <- gsub("Newsgroups: ", "", grep("^Newsgroups:", mail, value = TRUE))  
   
         if (!lodsupport || (lodsupport && load)) {  
             # The header is separated from the body by a blank line.  
             # Reference: \url{http://en.wikipedia.org/wiki/E-mail#Internet_e-mail_format}  
             for (index in seq(along = mail)) {  
                 if (mail[index] == "")  
                     break  
102              }              }
             content <- mail[(index + 1):length(mail)]  
103    
104              doc <- new("NewsgroupDocument", .Data = content, URI = elem$uri, Cached = TRUE,  `[[.PCorpus` <-
105                         Author = author, DateTimeStamp = datetimestamp,  function(x, i)
106                         Description = "", ID = id, Origin = origin,  {
107                         Heading = heading, Newsgroup = newsgroup)      i <- .map_name_index(x, i)
108          } else {      db <- filehash::dbInit(x$dbcontrol[["dbName"]], x$dbcontrol[["dbType"]])
109              doc <- new("NewsgroupDocument", URI = elem$uri, Cached = FALSE, Author = author, DateTimeStamp = datetimestamp,      filehash::dbFetch(db, x$content[[i]])
110                         Description = "", ID = id, Origin = origin, Heading = heading, Newsgroup = newsgroup)  }
111          }  `[[.VCorpus` <-
112    function(x, i)
113    {
114        i <- .map_name_index(x, i)
115        if (!is.null(x$lazy))
116            .Call(copyCorpus, x, materialize(x, i))
117        x$content[[i]]
118    }
119    
120    `[[<-.PCorpus` <-
121    function(x, i, value)
122    {
123        i <- .map_name_index(x, i)
124        db <- filehash::dbInit(x$dbcontrol[["dbName"]], x$dbcontrol[["dbType"]])
125        db[[x$content[[i]]]] <- value
126        x
127    }
128    `[[<-.VCorpus` <-
129    function(x, i, value)
130    {
131        i <- .map_name_index(x, i)
132        # Mark new objects as inactive for lazy mapping
133        if (!is.null(x$lazy))
134            x$lazy$index[i] <- FALSE
135        x$content[[i]] <- value
136        x
137    }
138    
139    as.list.PCorpus <- as.list.VCorpus <-
140    function(x, ...)
141        content(x)
142    
143    as.VCorpus <-
144    function(x)
145        UseMethod("as.VCorpus")
146    as.VCorpus.VCorpus <- identity
147    as.VCorpus.list <-
148    function(x)
149    {
150        v <- list(content = x,
151                  meta = CorpusMeta(),
152                  dmeta = data.frame(row.names = seq_along(x)))
153        class(v) <- c("VCorpus", "Corpus")
154        v
155    }
156    
157    outer_union <-
158    function(x, y, ...)
159    {
160        if (nrow(x) > 0L)
161            x[, setdiff(names(y), names(x))] <- NA
162        if (nrow(y) > 0L)
163            y[, setdiff(names(x), names(y))] <- NA
164        res <- rbind(x, y)
165        if (ncol(res) == 0L)
166            res <- data.frame(row.names = seq_len(nrow(x) + nrow(y)))
167        res
168    }
169    
170    c.VCorpus <-
171    function(..., recursive = FALSE)
172    {
173        args <- list(...)
174        x <- args[[1L]]
175    
176          return(doc)      if (length(args) == 1L)
177      }          return(x)
 }  
 class(newsgroup_parser) <- "function_generator"  
178    
179  # Parse a <newsitem></newsitem> element from a well-formed RCV1 XML file      if (!all(unlist(lapply(args, inherits, class(x)))))
180  rcv1_to_plain <- function(node, ...) {          stop("not all arguments are of the same corpus type")
     datetimestamp <- xmlAttrs(node)[["date"]]  
     id <- xmlAttrs(node)[["itemid"]]  
     origin <- "Reuters Corpus Volume 1 XML"  
     corpus <- unlist(xmlApply(node[["text"]], xmlValue), use.names = FALSE)  
     heading <- xmlValue(node[["title"]])  
181    
182      new("PlainTextDocument", .Data = corpus, Cached = TRUE, URI = "", Author = "", DateTimeStamp = datetimestamp,      v <- list(content = do.call("c", lapply(args, content)),
183          Description = "", ID = id, Origin = "Reuters Corpus Volume 1 XML", Heading = heading)                meta = CorpusMeta(meta = do.call("c",
184                    lapply(args, function(a) meta(a, type = "corpus")))),
185                  dmeta = Reduce(outer_union, lapply(args, meta)))
186        class(v) <- c("VCorpus", "Corpus")
187        v
188    }
189    
190    content.VCorpus <-
191    function(x)
192    {
193        if (!is.null(x$lazy))
194            .Call(copyCorpus, x, materialize(x))
195        x$content
196    }
197    
198    content.PCorpus <-
199    function(x)
200    {
201        db <- filehash::dbInit(x$dbcontrol[["dbName"]], x$dbcontrol[["dbType"]])
202        filehash::dbMultiFetch(db, unlist(x$content))
203    }
204    
205    inspect <-
206    function(x)
207        UseMethod("inspect", x)
208    inspect.PCorpus <- inspect.VCorpus <-
209    function(x)
210    {
211        print(x)
212        cat("\n")
213        print(noquote(content(x)))
214        invisible(x)
215  }  }
216    
217  # Parse a <REUTERS></REUTERS> element from a well-formed Reuters-21578 XML file  length.PCorpus <- length.VCorpus <-
218  reut21578xml_to_plain <- function(node, ...) {  function(x)
219      # The <AUTHOR></AUTHOR> tag is unfortunately NOT obligatory!      length(x$content)
     if (!is.null(node[["TEXT"]][["AUTHOR"]]))  
         author <- xmlValue(node[["TEXT"]][["AUTHOR"]])  
     else  
         author <- ""  
   
     datetimestamp <- xmlValue(node[["DATE"]])  
     description <- ""  
     id <- xmlAttrs(node)[["NEWID"]]  
   
     origin <- "Reuters-21578 XML"  
220    
221      # The <BODY></BODY> tag is unfortunately NOT obligatory!  names.PCorpus <- names.VCorpus <-
222      if (!is.null(node[["TEXT"]][["BODY"]]))  function(x)
223          corpus <- xmlValue(node[["TEXT"]][["BODY"]])      as.character(meta(x, "id", "local"))
     else  
         corpus <- ""  
224    
225      # The <TITLE></TITLE> tag is unfortunately NOT obligatory!  `names<-.PCorpus` <- `names<-.VCorpus` <-
226      if (!is.null(node[["TEXT"]][["TITLE"]]))  function(x, value)
227          heading <- xmlValue(node[["TEXT"]][["TITLE"]])  {
228      else      meta(x, "id", "local") <- as.character(value)
229          heading <- ""      x
230    }
     topics <- unlist(xmlApply(node[["TOPICS"]], function(x) xmlValue(x)), use.names = FALSE)  
231    
232      new("PlainTextDocument", .Data = corpus, Cached = TRUE, URI = "", Author = author, DateTimeStamp = datetimestamp,  print.PCorpus <- print.VCorpus <-
233          Description = description, ID = id, Origin = origin, Heading = heading, LocalMetaData = list(Topics = topics))  function(x, ...)
234    {
235        writeLines(sprintf("<<%s (documents: %d, metadata (corpus/indexed): %d/%d)>>",
236                           class(x)[1],
237                           length(x),
238                           length(meta(x, type = "corpus")),
239                           ncol(meta(x, type = "indexed"))))
240        invisible(x)
241  }  }
242    
243  setGeneric("load_doc", function(object, ...) standardGeneric("load_doc"))  writeCorpus <-
244  setMethod("load_doc",  function(x, path = ".", filenames = NULL)
245            signature(object = "PlainTextDocument"),  {
246            function(object, ...) {      filenames <- file.path(path,
247                if (!Cached(object)) {        if (is.null(filenames))
248                    con <- eval(URI(object))            sprintf("%s.txt", as.character(meta(x, "id", "local")))
249                    corpus <- readLines(con)        else filenames)
                   close(con)  
                   Corpus(object) <- corpus  
                   Cached(object) <- TRUE  
                   return(object)  
               } else {  
                   return(object)  
               }  
           })  
 setMethod("load_doc",  
           signature(object =  "XMLTextDocument"),  
           function(object, ...) {  
               if (!Cached(object)) {  
                   con <- eval(URI(object))  
                   corpus <- paste(readLines(con), "\n", collapse = "")  
                   close(con)  
                   doc <- xmlTreeParse(corpus, asText = TRUE)  
                   class(doc) <- "list"  
                   Corpus(object) <- doc  
                   Cached(object) <- TRUE  
                   return(object)  
               } else {  
                   return(object)  
               }  
           })  
 setMethod("load_doc",  
           signature(object = "NewsgroupDocument"),  
           function(object, ...) {  
               if (!Cached(object)) {  
                   con <- eval(URI(object))  
                   mail <- readLines(con)  
                   close(con)  
                   Cached(object) <- TRUE  
                   for (index in seq(along = mail)) {  
                       if (mail[index] == "")  
                           break  
                   }  
                   Corpus(object) <- mail[(index + 1):length(mail)]  
                   return(object)  
               } else {  
                   return(object)  
               }  
           })  
   
 setGeneric("tm_transform", function(object, FUN, ...) standardGeneric("tm_transform"))  
 setMethod("tm_transform",  
           signature(object = "TextDocCol", FUN = "function"),  
           function(object, FUN, ...) {  
               result <- as(lapply(object, FUN, ..., GlobalMetaData = GlobalMetaData(object)), "TextDocCol")  
               result@GlobalMetaData <- GlobalMetaData(object)  
               return(result)  
           })  
   
 setGeneric("as.plaintext_doc", function(object, FUN, ...) standardGeneric("as.plaintext_doc"))  
 setMethod("as.plaintext_doc",  
           signature(object = "PlainTextDocument"),  
           function(object, FUN, ...) {  
               return(object)  
           })  
 setMethod("as.plaintext_doc",  
           signature(object = "XMLTextDocument", FUN = "function"),  
           function(object, FUN, ...) {  
               if (!Cached(object))  
                   object <- load_doc(object)  
   
               corpus <- Corpus(object)  
   
               # As XMLDocument is no native S4 class, restore valid information  
               class(corpus) <- "XMLDocument"  
               names(corpus) <- c("doc","dtd")  
   
               return(FUN(xmlRoot(corpus), ...))  
           })  
   
 setGeneric("tm_tolower", function(object, ...) standardGeneric("tm_tolower"))  
 setMethod("tm_tolower",  
           signature(object = "PlainTextDocument"),  
           function(object, ...) {  
               if (!Cached(object))  
                   object <- load_doc(object)  
   
               Corpus(object) <- tolower(object)  
               return(object)  
           })  
   
 setGeneric("strip_whitespace", function(object, ...) standardGeneric("strip_whitespace"))  
 setMethod("strip_whitespace",  
           signature(object = "PlainTextDocument"),  
           function(object, ...) {  
               if (!Cached(object))  
                   object <- load_doc(object)  
   
               Corpus(object) <- gsub("[[:space:]]+", " ", object)  
               return(object)  
           })  
   
 setGeneric("stem_doc", function(object, ...) standardGeneric("stem_doc"))  
 setMethod("stem_doc",  
           signature(object = "PlainTextDocument"),  
           function(object, ...) {  
               if (!Cached(object))  
                   object <- load_doc(object)  
   
               require(Rstem)  
               splittedCorpus <- unlist(strsplit(object, " ", fixed = TRUE))  
               stemmedCorpus <- wordStem(splittedCorpus)  
               Corpus(object) <- paste(stemmedCorpus, collapse = " ")  
               return(object)  
           })  
   
 setGeneric("remove_words", function(object, stopwords, ...) standardGeneric("remove_words"))  
 setMethod("remove_words",  
           signature(object = "PlainTextDocument", stopwords = "character"),  
           function(object, stopwords, ...) {  
               if (!Cached(object))  
                   object <- load_doc(object)  
   
               require(Rstem)  
               splittedCorpus <- unlist(strsplit(object, " ", fixed = TRUE))  
               noStopwordsCorpus <- splittedCorpus[!splittedCorpus %in% stopwords]  
               Corpus(object) <- paste(noStopwordsCorpus, collapse = " ")  
               return(object)  
           })  
   
 setGeneric("tm_filter", function(object, ..., FUN = s_filter) standardGeneric("tm_filter"))  
 setMethod("tm_filter",  
           signature(object = "TextDocCol"),  
           function(object, ..., FUN = s_filter) {  
               indices <- sapply(object, FUN, ..., GlobalMetaData = GlobalMetaData(object))  
               object[indices]  
           })  
   
 setGeneric("tm_index", function(object, ..., FUN = s_filter) standardGeneric("tm_index"))  
 setMethod("tm_index",  
           signature(object = "TextDocCol"),  
           function(object, ..., FUN = s_filter) {  
               sapply(object, FUN, ..., GlobalMetaData = GlobalMetaData(object))  
           })  
   
 s_filter <- function(object, s, ..., GlobalMetaData) {  
     b <- TRUE  
     for (tag in names(s)) {  
         if (tag %in% names(LocalMetaData(object))) {  
             b <- b && any(grep(s[[tag]], LocalMetaData(object)[[tag]]))  
         } else if (tag %in% names(GlobalMetaData)){  
             b <- b && any(grep(s[[tag]], GlobalMetaData[[tag]]))  
         } else {  
             b <- b && any(grep(s[[tag]], eval(call(tag, object))))  
         }  
     }  
     return(b)  
 }  
   
 setGeneric("fulltext_search_filter", function(object, pattern, ...) standardGeneric("fulltext_search_filter"))  
 setMethod("fulltext_search_filter",  
           signature(object = "PlainTextDocument", pattern = "character"),  
           function(object, pattern, ...) {  
               if (!Cached(object))  
                   object <- load_doc(object)  
   
               return(any(grep(pattern, Corpus(object))))  
           })  
   
 setGeneric("attach_data", function(object, data) standardGeneric("attach_data"))  
 setMethod("attach_data",  
           signature(object = "TextDocCol", data = "TextDocument"),  
           function(object, data) {  
               data <- as(list(data), "TextDocCol")  
               object@.Data <- as(c(object@.Data, data), "TextDocCol")  
               return(object)  
           })  
   
 setGeneric("attach_metadata", function(object, name, metadata) standardGeneric("attach_metadata"))  
 setMethod("attach_metadata",  
           signature(object = "TextDocCol"),  
           function(object, name, metadata) {  
               object@GlobalMetaData <- c(GlobalMetaData(object), new = list(metadata))  
               names(object@GlobalMetaData)[length(names(GlobalMetaData(object)))] <- name  
               return(object)  
           })  
   
 setGeneric("remove_metadata", function(object, name) standardGeneric("remove_metadata"))  
 setMethod("remove_metadata",  
           signature(object = "TextDocCol"),  
           function(object, name) {  
               object@GlobalMetaData <- GlobalMetaData(object)[names(GlobalMetaData(object)) != name]  
               return(object)  
           })  
   
 setGeneric("modify_metadata", function(object, name, metadata) standardGeneric("modify_metadata"))  
 setMethod("modify_metadata",  
           signature(object = "TextDocCol"),  
           function(object, name, metadata) {  
               object@GlobalMetaData[[name]] <- metadata  
               return(object)  
           })  
   
 setGeneric("set_subscriptable", function(object, name) standardGeneric("set_subscriptable"))  
 setMethod("set_subscriptable",  
           signature(object = "TextDocCol"),  
           function(object, name) {  
               if (!is.character(GlobalMetaData(object)$subscriptable))  
                   object <- attach_metadata(object, "subscriptable", name)  
               else  
                   object@GlobalMetaData$subscriptable <- c(GlobalMetaData(object)$subscriptable, name)  
               return(object)  
           })  
   
 setMethod("[",  
           signature(x = "TextDocCol", i = "ANY", j = "ANY", drop = "ANY"),  
           function(x, i, j, ... , drop) {  
               if(missing(i))  
                   return(x)  
250    
251                object <- x      stopifnot(length(x) == length(filenames))
               object@.Data <- x@.Data[i, ..., drop = FALSE]  
               for (m in names(GlobalMetaData(object))) {  
                   if (m %in% GlobalMetaData(object)$subscriptable) {  
                       object@GlobalMetaData[[m]] <- GlobalMetaData(object)[[m]][i, ..., drop = FALSE]  
                   }  
               }  
               return(object)  
           })  
   
 setMethod("[<-",  
           signature(x = "TextDocCol", i = "ANY", j = "ANY", value = "ANY"),  
           function(x, i, j, ... , value) {  
               object <- x  
               object@.Data[i, ...] <- value  
               return(object)  
           })  
   
 setMethod("[[",  
           signature(x = "TextDocCol", i = "ANY", j = "ANY"),  
           function(x, i, j, ...) {  
               return(x@.Data[[i, ...]])  
           })  
   
 setMethod("[[<-",  
           signature(x = "TextDocCol", i = "ANY", j = "ANY", value = "ANY"),  
           function(x, i, j, ..., value) {  
               object <- x  
               object@.Data[[i, ...]] <- value  
               return(object)  
           })  
   
 setMethod("c",  
           signature(x = "TextDocCol"),  
           function(x, ..., recursive = TRUE){  
               args <- list(...)  
               if(length(args) == 0)  
                   return(x)  
               return(as(c(as(x, "list"), ...), "TextDocCol"))  
     })  
 setMethod("c",  
           signature(x = "TextDocument"),  
           function(x, ..., recursive = TRUE){  
               args <- list(...)  
               if(length(args) == 0)  
                   return(x)  
               return(new("TextDocCol", .Data = list(x, ...)))  
     })  
252    
253  setMethod("length",      mapply(function(doc, f) writeLines(as.character(doc), f), x, filenames)
           signature(x = "TextDocCol"),  
           function(x){  
               return(length(as(x, "list")))  
     })  
   
 setMethod("show",  
           signature(object = "TextDocCol"),  
           function(object){  
               cat(sprintf(ngettext(length(object),  
                                    "A text document collection with %d text document\n",  
                                    "A text document collection with %d text documents\n"),  
                           length(object)))  
     })  
   
 setMethod("summary",  
           signature(object = "TextDocCol"),  
           function(object){  
               show(object)  
               if (length(GlobalMetaData(object)) > 0) {  
                   cat(sprintf(ngettext(length(GlobalMetaData(object)),  
                                               "\nThe global metadata consists of %d tag-value pair\n",  
                                               "\nThe global metadata consists of %d tag-value pairs\n"),  
                                        length(GlobalMetaData(object))))  
                   cat("Available tags are:\n")  
                   cat(names(GlobalMetaData(object)), "\n")  
               }  
     })  
   
 setGeneric("inspect", function(object) standardGeneric("inspect"))  
 setMethod("inspect",  
           signature("TextDocCol"),  
           function(object) {  
               summary(object)  
               cat("\n")  
               show(as(object, "list"))  
           })  
254    
255  # No metadata is checked      invisible(x)
256  setGeneric("%IN%", function(x, y) standardGeneric("%IN%"))  }
 setMethod("%IN%",  
           signature(x = "TextDocument", y = "TextDocCol"),  
           function(x, y) {  
               x %in% y  
           })  

Legend:
Removed from v.70  
changed lines
  Added in v.1409

root@r-forge.r-project.org
ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.0.0  
Thanks to:
Vienna University of Economics and Business Powered By FusionForge