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[matrix] Annotation of /pkg/Matrix/src/dtCMatrix.c
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Annotation of /pkg/Matrix/src/dtCMatrix.c

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Revision 2220 - (view) (download) (as text)
Original Path: pkg/src/dtCMatrix.c

1 : bates 741 /* Sparse triangular numeric matrices */
2 : bates 478 #include "dtCMatrix.h"
3 : bates 1251 #include "cs_utils.h"
4 : bates 10
5 : maechler 1968 #define RETURN(_CH_) UNPROTECT(1); return (_CH_);
6 :    
7 :     /* This is used for *BOTH* triangular and symmetric Csparse: */
8 : maechler 1710 SEXP tCMatrix_validate(SEXP x)
9 :     {
10 :     SEXP val = xCMatrix_validate(x);/* checks x slot */
11 :     if(isString(val))
12 :     return(val);
13 :     else {
14 :     SEXP
15 :     islot = GET_SLOT(x, Matrix_iSym),
16 :     pslot = GET_SLOT(x, Matrix_pSym);
17 :     int uploT = (*uplo_P(x) == 'U'),
18 :     k, nnz = length(islot),
19 :     *xi = INTEGER(islot),
20 :     *xj = INTEGER(PROTECT(allocVector(INTSXP, nnz)));
21 :    
22 :     expand_cmprPt(length(pslot) - 1, INTEGER(pslot), xj);
23 :    
24 :     /* Maybe FIXME: ">" should be ">=" for diag = 'U' (uplo = 'U') */
25 :     if(uploT) {
26 :     for (k = 0; k < nnz; k++)
27 :     if(xi[k] > xj[k]) {
28 : dmbates 2208 RETURN(mkString(_("uplo='U' must not have sparse entries below the diagonal")));
29 : maechler 1710 }
30 :     }
31 :     else {
32 :     for (k = 0; k < nnz; k++)
33 :     if(xi[k] < xj[k]) {
34 : dmbates 2208 RETURN(mkString(_("uplo='L' must not have sparse entries above the diagonal")));
35 : maechler 1710 }
36 :     }
37 :    
38 :     RETURN(ScalarLogical(1));
39 :     }
40 :     }
41 : maechler 1968
42 :     /* This is used for *BOTH* triangular and symmetric Rsparse: */
43 :     SEXP tRMatrix_validate(SEXP x)
44 :     {
45 :     SEXP val = xRMatrix_validate(x);/* checks x slot */
46 :     if(isString(val))
47 :     return(val);
48 :     else {
49 :     SEXP
50 :     jslot = GET_SLOT(x, Matrix_jSym),
51 :     pslot = GET_SLOT(x, Matrix_pSym);
52 :     int uploT = (*uplo_P(x) == 'U'),
53 :     k, nnz = length(jslot),
54 :     *xj = INTEGER(jslot),
55 :     *xi = INTEGER(PROTECT(allocVector(INTSXP, nnz)));
56 :    
57 :     expand_cmprPt(length(pslot) - 1, INTEGER(pslot), xi);
58 :    
59 :     /* Maybe FIXME: ">" should be ">=" for diag = 'U' (uplo = 'U') */
60 :     if(uploT) {
61 :     for (k = 0; k < nnz; k++)
62 :     if(xi[k] > xj[k]) {
63 : dmbates 2208 RETURN(mkString(_("uplo='U' must not have sparse entries below the diagonal")));
64 : maechler 1968 }
65 :     }
66 :     else {
67 :     for (k = 0; k < nnz; k++)
68 :     if(xi[k] < xj[k]) {
69 : dmbates 2208 RETURN(mkString(_("uplo='L' must not have sparse entries above the diagonal")));
70 : maechler 1968 }
71 :     }
72 :    
73 :     RETURN(ScalarLogical(1));
74 :     }
75 :     }
76 :    
77 : maechler 1710 #undef RETURN
78 :    
79 : bates 1251 SEXP dtCMatrix_matrix_solve(SEXP a, SEXP b, SEXP classed)
80 :     {
81 :     int cl = asLogical(classed);
82 :     SEXP ans = PROTECT(NEW_OBJECT(MAKE_CLASS("dgeMatrix")));
83 : dmbates 2210 CSP A = AS_CSP(Csparse_diagU2N(a));
84 : bates 1251 int *adims = INTEGER(GET_SLOT(a, Matrix_DimSym)),
85 :     *bdims = INTEGER(cl ? GET_SLOT(b, Matrix_DimSym) :
86 :     getAttrib(b, R_DimSymbol));
87 :     int j, n = bdims[0], nrhs = bdims[1], lo = (*uplo_P(a) == 'L');
88 :     double *bx;
89 : maechler 1960 R_CheckStack();
90 : bates 1251
91 :     if (*adims != n || nrhs < 1 || *adims < 1 || *adims != adims[1])
92 :     error(_("Dimensions of system to be solved are inconsistent"));
93 :     Memcpy(INTEGER(ALLOC_SLOT(ans, Matrix_DimSym, INTSXP, 2)), bdims, 2);
94 : maechler 1736 /* FIXME: copy dimnames or Dimnames as well */
95 : bates 1251 bx = Memcpy(REAL(ALLOC_SLOT(ans, Matrix_xSym, REALSXP, n * nrhs)),
96 :     REAL(cl ? GET_SLOT(b, Matrix_xSym):b), n * nrhs);
97 :     for (j = 0; j < nrhs; j++)
98 :     lo ? cs_lsolve(A, bx + n * j) : cs_usolve(A, bx + n * j);
99 :     UNPROTECT(1);
100 :     return ans;
101 :     }
102 : bates 1262
103 : dmbates 2210 SEXP dtCMatrix_sparse_solve(SEXP a, SEXP b)
104 : bates 1262 {
105 : dmbates 2217 SEXP ans = PROTECT(NEW_OBJECT(MAKE_CLASS("dgCMatrix")));
106 : dmbates 2210 CSP A = AS_CSP(Csparse_diagU2N(a)), B = AS_CSP(Csparse_diagU2N(b));
107 :     int *xp = INTEGER(ALLOC_SLOT(ans, Matrix_pSym, INTSXP, (B->n) + 1)),
108 : dmbates 2217 xnz = 10 * B->p[B->n]; /* initial estimate of nnz in x */
109 :     int *ti = Calloc(xnz, int), k, lo = uplo_P(a)[0] == 'L', pos = 0;
110 : dmbates 2210 double *tx = Calloc(xnz, double);
111 :     double *wrk = Alloca(A->n, double);
112 :     int *xi = Alloca(2*A->n, int); /* for cs_reach */
113 : maechler 1960 R_CheckStack();
114 : dmbates 2210
115 :     if (A->m != A->n || B->n < 1 || A->n < 1 || A->n != B->m)
116 :     error(_("Dimensions of system to be solved are inconsistent"));
117 :     slot_dup(ans, b, Matrix_DimSym);
118 :     SET_DimNames(ans, b);
119 :     xp[0] = 0;
120 : dmbates 2217 for (k = 0; k < B->n; k++) {
121 :     int top = cs_spsolve (A, B, k, xi, wrk, (int *)NULL, lo);
122 :     int nz = A->n - top, p;
123 :    
124 :     xp[k + 1] = nz + xp[k];
125 :     if (xp[k + 1] > xnz) {
126 :     while (xp[k + 1] > xnz) xnz *= 2;
127 : dmbates 2210 ti = Realloc(ti, xnz, int);
128 :     tx = Realloc(tx, xnz, double);
129 : bates 1262 }
130 : dmbates 2217 if (lo) /* increasing row order */
131 : dmbates 2210 for(p = top; p < A->n; p++, pos++) {
132 :     ti[pos] = xi[p];
133 :     tx[pos] = wrk[xi[p]];
134 :     }
135 : dmbates 2217 else /* decreasing order, reverse copy */
136 : dmbates 2210 for(p = A->n - 1; p >= top; p--, pos++) {
137 :     ti[pos] = xi[p];
138 :     tx[pos] = wrk[xi[p]];
139 :     }
140 : bates 1262 }
141 : dmbates 2220 xnz = xp[B->n];
142 : dmbates 2217 Memcpy(INTEGER(ALLOC_SLOT(ans, Matrix_iSym, INTSXP, xnz)), ti, xnz);
143 :     Memcpy( REAL(ALLOC_SLOT(ans, Matrix_xSym, REALSXP, xnz)), tx, xnz);
144 : dmbates 2210
145 :     Free(ti); Free(tx);
146 : bates 1262 UNPROTECT(1);
147 :     return ans;
148 :     }

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