SCM

SCM Repository

[matrix] Diff of /pkg/Matrix/src/Csparse.c
ViewVC logotype

Diff of /pkg/Matrix/src/Csparse.c

Parent Directory Parent Directory | Revision Log Revision Log | View Patch Patch

revision 1555, Wed Sep 13 14:47:28 2006 UTC revision 1893, Thu Jun 14 10:46:10 2007 UTC
# Line 4  Line 4 
4    
5  SEXP Csparse_validate(SEXP x)  SEXP Csparse_validate(SEXP x)
6  {  {
7      cholmod_sparse *chx = as_cholmod_sparse(x);      /* NB: we do *NOT* check a potential 'x' slot here, at all */
8      SEXP pslot = GET_SLOT(x, Matrix_pSym),      SEXP pslot = GET_SLOT(x, Matrix_pSym),
9          islot = GET_SLOT(x, Matrix_iSym);          islot = GET_SLOT(x, Matrix_iSym);
10      int j, k, ncol = length(pslot) - 1,      Rboolean sorted, strictly;
11        int j, k,
12          *dims = INTEGER(GET_SLOT(x, Matrix_DimSym)),          *dims = INTEGER(GET_SLOT(x, Matrix_DimSym)),
13          nrow, sorted, *xp = INTEGER(pslot),          nrow = dims[0],
14            ncol = dims[1],
15            *xp = INTEGER(pslot),
16          *xi = INTEGER(islot);          *xi = INTEGER(islot);
17    
18      nrow = dims[0];      if (length(pslot) != dims[1] + 1)
19      if (length(pslot) <= 0)          return mkString(_("slot p must have length = ncol(.) + 1"));
         return mkString(_("slot p must have length > 0"));  
20      if (xp[0] != 0)      if (xp[0] != 0)
21          return mkString(_("first element of slot p must be zero"));          return mkString(_("first element of slot p must be zero"));
22      if (length(islot) != xp[ncol])      if (length(islot) < xp[ncol]) /* allow larger slots from over-allocation!*/
23          return          return
24              mkString(_("last element of slot p must match length of slots i and x"));              mkString(_("last element of slot p must match length of slots i and x"));
25      for (j = 0; j < length(islot); j++) {      for (j = 0; j < length(islot); j++) {
26          if (xi[j] < 0 || xi[j] >= nrow)          if (xi[j] < 0 || xi[j] >= nrow)
27              return mkString(_("all row indices must be between 0 and nrow-1"));              return mkString(_("all row indices must be between 0 and nrow-1"));
28      }      }
29      sorted = TRUE;      sorted = TRUE; strictly = TRUE;
30      for (j = 0; j < ncol; j++) {      for (j = 0; j < ncol; j++) {
31          if (xp[j] > xp[j+1])          if (xp[j] > xp[j+1])
32              return mkString(_("slot p must be non-decreasing"));              return mkString(_("slot p must be non-decreasing"));
33          for (k = xp[j] + 1; k < xp[j + 1]; k++)          if(sorted)
34              if (xi[k] < xi[k - 1]) sorted = FALSE;              for (k = xp[j] + 1; k < xp[j + 1]; k++) {
35                    if (xi[k] < xi[k - 1])
36                        sorted = FALSE;
37                    else if (xi[k] == xi[k - 1])
38                        strictly = FALSE;
39      }      }
40      if (!sorted) cholmod_sort(chx, &c);      }
41        if (!sorted) {
42            cholmod_sparse *chx = as_cholmod_sparse(x);
43            cholmod_sort(chx, &c);
44      Free(chx);      Free(chx);
45            /* Now re-check that row indices are *strictly* increasing
46             * (and not just increasing) within each column : */
47            for (j = 0; j < ncol; j++) {
48                for (k = xp[j] + 1; k < xp[j + 1]; k++)
49                    if (xi[k] == xi[k - 1])
50                        return mkString(_("slot i is not *strictly* increasing inside a column (even after cholmod_sort)"));
51            }
52    
53        } else if(!strictly) {  /* sorted, but not strictly */
54            return mkString(_("slot i is not *strictly* increasing inside a column"));
55        }
56      return ScalarLogical(1);      return ScalarLogical(1);
57  }  }
58    
59    /* Called from ../R/Csparse.R : */
60    /* Can only return [dln]geMatrix (no symm/triang);
61     * FIXME: replace by non-CHOLMOD code ! */
62  SEXP Csparse_to_dense(SEXP x)  SEXP Csparse_to_dense(SEXP x)
63  {  {
64      cholmod_sparse *chxs = as_cholmod_sparse(x);      cholmod_sparse *chxs = as_cholmod_sparse(x);
65        /* This loses the symmetry property, since cholmod_dense has none,
66         * BUT, much worse (FIXME!), it also transforms CHOLMOD_PATTERN ("n") matrices
67         * to numeric (CHOLMOD_REAL) ones : */
68      cholmod_dense *chxd = cholmod_sparse_to_dense(chxs, &c);      cholmod_dense *chxd = cholmod_sparse_to_dense(chxs, &c);
69        int Rkind = (chxs->xtype == CHOLMOD_PATTERN)? -1 : Real_kind(x);
70    
71      Free(chxs);      Free(chxs);
72      return chm_dense_to_SEXP(chxd, 1, Real_kind(x));      return chm_dense_to_SEXP(chxd, 1, Rkind, GET_SLOT(x, Matrix_DimNamesSym));
73  }  }
74    
75  SEXP Csparse_to_nz_pattern(SEXP x, SEXP tri)  SEXP Csparse_to_nz_pattern(SEXP x, SEXP tri)
# Line 50  Line 77 
77      cholmod_sparse *chxs = as_cholmod_sparse(x);      cholmod_sparse *chxs = as_cholmod_sparse(x);
78      cholmod_sparse      cholmod_sparse
79          *chxcp = cholmod_copy(chxs, chxs->stype, CHOLMOD_PATTERN, &c);          *chxcp = cholmod_copy(chxs, chxs->stype, CHOLMOD_PATTERN, &c);
80      int uploT = 0; char *diag = "";      int tr = asLogical(tri);
81    
82      Free(chxs);      Free(chxs);
83      if (asLogical(tri)) {       /* triangular sparse matrices */      return chm_sparse_to_SEXP(chxcp, 1,
84          uploT = (strcmp(CHAR(asChar(GET_SLOT(x, Matrix_uploSym))), "U")) ?                                tr ? ((*uplo_P(x) == 'U') ? 1 : -1) : 0,
85              -1 : 1;                                0, tr ? diag_P(x) : "",
         diag = CHAR(asChar(GET_SLOT(x, Matrix_diagSym)));  
     }  
     return chm_sparse_to_SEXP(chxcp, 1, uploT, 0, diag,  
86                                GET_SLOT(x, Matrix_DimNamesSym));                                GET_SLOT(x, Matrix_DimNamesSym));
87  }  }
88    
# Line 76  Line 100 
100  {  {
101      cholmod_sparse *chxs = as_cholmod_sparse(x);      cholmod_sparse *chxs = as_cholmod_sparse(x);
102      cholmod_triplet *chxt = cholmod_sparse_to_triplet(chxs, &c);      cholmod_triplet *chxt = cholmod_sparse_to_triplet(chxs, &c);
103      int uploT = 0;      int tr = asLogical(tri);
104      char *diag = "";      int Rkind = (chxs->xtype != CHOLMOD_PATTERN) ? Real_kind(x) : 0;
     int Rkind = (chxs->xtype == CHOLMOD_REAL) ? Real_kind(x) : 0;  
105    
106      Free(chxs);      Free(chxs);
107      if (asLogical(tri)) {       /* triangular sparse matrices */      return chm_triplet_to_SEXP(chxt, 1,
108          uploT = (*uplo_P(x) == 'U') ? -1 : 1;                                 tr ? ((*uplo_P(x) == 'U') ? 1 : -1) : 0,
109          diag = diag_P(x);                                 Rkind, tr ? diag_P(x) : "",
     }  
     return chm_triplet_to_SEXP(chxt, 1, uploT, Rkind, diag,  
110                                 GET_SLOT(x, Matrix_DimNamesSym));                                 GET_SLOT(x, Matrix_DimNamesSym));
111  }  }
112    
# Line 93  Line 114 
114  SEXP Csparse_symmetric_to_general(SEXP x)  SEXP Csparse_symmetric_to_general(SEXP x)
115  {  {
116      cholmod_sparse *chx = as_cholmod_sparse(x), *chgx;      cholmod_sparse *chx = as_cholmod_sparse(x), *chgx;
117      int Rkind = (chx->xtype == CHOLMOD_REAL) ? Real_kind(x) : 0;      int Rkind = (chx->xtype != CHOLMOD_PATTERN) ? Real_kind(x) : 0;
118    
119      if (!(chx->stype))      if (!(chx->stype))
120          error(_("Nonsymmetric matrix in Csparse_symmetric_to_general"));          error(_("Nonsymmetric matrix in Csparse_symmetric_to_general"));
# Line 104  Line 125 
125                                GET_SLOT(x, Matrix_DimNamesSym));                                GET_SLOT(x, Matrix_DimNamesSym));
126  }  }
127    
128    SEXP Csparse_general_to_symmetric(SEXP x, SEXP uplo)
129    {
130        cholmod_sparse *chx = as_cholmod_sparse(x), *chgx;
131        int uploT = (*CHAR(asChar(uplo)) == 'U') ? 1 : -1;
132        int Rkind = (chx->xtype != CHOLMOD_PATTERN) ? Real_kind(x) : 0;
133    
134        chgx = cholmod_copy(chx, /* stype: */ uploT, chx->xtype, &c);
135        /* xtype: pattern, "real", complex or .. */
136        Free(chx);
137        return chm_sparse_to_SEXP(chgx, 1, 0, Rkind, "",
138                                  GET_SLOT(x, Matrix_DimNamesSym));
139    }
140    
141  SEXP Csparse_transpose(SEXP x, SEXP tri)  SEXP Csparse_transpose(SEXP x, SEXP tri)
142  {  {
143      cholmod_sparse *chx = as_cholmod_sparse(x);      cholmod_sparse *chx = as_cholmod_sparse(x);
144        int Rkind = (chx->xtype != CHOLMOD_PATTERN) ? Real_kind(x) : 0;
145      cholmod_sparse *chxt = cholmod_transpose(chx, (int) chx->xtype, &c);      cholmod_sparse *chxt = cholmod_transpose(chx, (int) chx->xtype, &c);
146      SEXP dn = PROTECT(duplicate(GET_SLOT(x, Matrix_DimNamesSym))), tmp;      SEXP dn = PROTECT(duplicate(GET_SLOT(x, Matrix_DimNamesSym))), tmp;
147      int uploT = 0; char *diag = "";      int tr = asLogical(tri);
     int Rkind = (chx->xtype == CHOLMOD_REAL) ? Real_kind(x) : 0;  
148    
149      Free(chx);      Free(chx);
150      tmp = VECTOR_ELT(dn, 0);    /* swap the dimnames */      tmp = VECTOR_ELT(dn, 0);    /* swap the dimnames */
151      SET_VECTOR_ELT(dn, 0, VECTOR_ELT(dn, 1));      SET_VECTOR_ELT(dn, 0, VECTOR_ELT(dn, 1));
152      SET_VECTOR_ELT(dn, 1, tmp);      SET_VECTOR_ELT(dn, 1, tmp);
153      UNPROTECT(1);      UNPROTECT(1);
154      if (asLogical(tri)) {       /* triangular sparse matrices */      return chm_sparse_to_SEXP(chxt, 1, /* SWAP 'uplo' for triangular */
155          uploT = (*uplo_P(x) == 'U') ? -1 : 1;                                tr ? ((*uplo_P(x) == 'U') ? -1 : 1) : 0,
156          diag = diag_P(x);                                Rkind, tr ? diag_P(x) : "", dn);
     }  
     return chm_sparse_to_SEXP(chxt, 1, uploT, Rkind, diag, dn);  
157  }  }
158    
159  SEXP Csparse_Csparse_prod(SEXP a, SEXP b)  SEXP Csparse_Csparse_prod(SEXP a, SEXP b)
160  {  {
161      cholmod_sparse *cha = as_cholmod_sparse(a),      cholmod_sparse
162            *cha = as_cholmod_sparse(a),
163          *chb = as_cholmod_sparse(b);          *chb = as_cholmod_sparse(b);
164      cholmod_sparse *chc = cholmod_ssmult(cha, chb, 0, cha->xtype, 1, &c);      cholmod_sparse *chc = cholmod_ssmult(cha, chb, 0, cha->xtype, 1, &c);
165      SEXP dn = allocVector(VECSXP, 2);      SEXP dn = allocVector(VECSXP, 2);
# Line 139  Line 172 
172      return chm_sparse_to_SEXP(chc, 1, 0, 0, "", dn);      return chm_sparse_to_SEXP(chc, 1, 0, 0, "", dn);
173  }  }
174    
175    SEXP Csparse_Csparse_crossprod(SEXP a, SEXP b, SEXP trans)
176    {
177        int tr = asLogical(trans);
178        cholmod_sparse
179            *cha = as_cholmod_sparse(a),
180            *chb = as_cholmod_sparse(b);
181        cholmod_sparse *chTr, *chc;
182        SEXP dn = allocVector(VECSXP, 2);
183    
184    /*     cholmod_sparse *chTr = cholmod_transpose(cha, 1, &c); */
185    /*     cholmod_sparse *chc = cholmod_ssmult(chTr, chb, 0, cha->xtype, 1, &c); */
186    
187        if (tr)
188            chTr = cholmod_transpose(chb, chb->xtype, &c);
189        else
190            chTr = cholmod_transpose(cha, cha->xtype, &c);
191        chc = cholmod_ssmult((tr) ? cha : chTr, (tr) ? chTr : chb,
192                             0, cha->xtype, 1, &c);
193    
194        Free(cha); Free(chb); cholmod_free_sparse(&chTr, &c);
195    
196        SET_VECTOR_ELT(dn, 0,       /* establish dimnames */
197                       duplicate(VECTOR_ELT(GET_SLOT(a, Matrix_DimNamesSym), (tr) ? 0 : 1)));
198        SET_VECTOR_ELT(dn, 1,
199                       duplicate(VECTOR_ELT(GET_SLOT(b, Matrix_DimNamesSym), (tr) ? 0 : 1)));
200        return chm_sparse_to_SEXP(chc, 1, 0, 0, "", dn);
201    }
202    
203  SEXP Csparse_dense_prod(SEXP a, SEXP b)  SEXP Csparse_dense_prod(SEXP a, SEXP b)
204  {  {
205      cholmod_sparse *cha = as_cholmod_sparse(a);      cholmod_sparse *cha = as_cholmod_sparse(a);
206      cholmod_dense *chb = as_cholmod_dense(PROTECT(mMatrix_as_dgeMatrix(b)));      SEXP b_M = PROTECT(mMatrix_as_dgeMatrix(b));
207        cholmod_dense *chb = as_cholmod_dense(b_M);
208      cholmod_dense *chc =      cholmod_dense *chc =
209          cholmod_allocate_dense(cha->nrow, chb->ncol, cha->nrow, chb->xtype, &c);          cholmod_allocate_dense(cha->nrow, chb->ncol, cha->nrow, chb->xtype, &c);
210        SEXP dn = allocVector(VECSXP, 2);
211      double alpha[] = {1,0}, beta[] = {0,0};      double alpha[] = {1,0}, beta[] = {0,0};
212    
213      cholmod_sdmult(cha, 0, alpha, beta, chb, chc, &c);      cholmod_sdmult(cha, 0, alpha, beta, chb, chc, &c);
214      Free(cha); Free(chb);      Free(cha); Free(chb);
215      UNPROTECT(1);      UNPROTECT(1);
216      return chm_dense_to_SEXP(chc, 1, 0);      SET_VECTOR_ELT(dn, 0,       /* establish dimnames */
217                       duplicate(VECTOR_ELT(GET_SLOT(a, Matrix_DimNamesSym), 0)));
218        SET_VECTOR_ELT(dn, 1,
219                       duplicate(VECTOR_ELT(GET_SLOT(b_M, Matrix_DimNamesSym), 1)));
220        return chm_dense_to_SEXP(chc, 1, 0, dn);
221  }  }
222    
223  SEXP Csparse_dense_crossprod(SEXP a, SEXP b)  SEXP Csparse_dense_crossprod(SEXP a, SEXP b)
224  {  {
225      cholmod_sparse *cha = as_cholmod_sparse(a);      cholmod_sparse *cha = as_cholmod_sparse(a);
226      cholmod_dense *chb = as_cholmod_dense(PROTECT(mMatrix_as_dgeMatrix(b)));      SEXP b_M = PROTECT(mMatrix_as_dgeMatrix(b));
227        cholmod_dense *chb = as_cholmod_dense(b_M);
228      cholmod_dense *chc =      cholmod_dense *chc =
229          cholmod_allocate_dense(cha->ncol, chb->ncol, cha->ncol, chb->xtype, &c);          cholmod_allocate_dense(cha->ncol, chb->ncol, cha->ncol, chb->xtype, &c);
230        SEXP dn = allocVector(VECSXP, 2);
231      double alpha[] = {1,0}, beta[] = {0,0};      double alpha[] = {1,0}, beta[] = {0,0};
232    
233      cholmod_sdmult(cha, 1, alpha, beta, chb, chc, &c);      cholmod_sdmult(cha, 1, alpha, beta, chb, chc, &c);
234      Free(cha); Free(chb);      Free(cha); Free(chb);
235      UNPROTECT(1);      UNPROTECT(1);
236      return chm_dense_to_SEXP(chc, 1, 0);      SET_VECTOR_ELT(dn, 0,       /* establish dimnames */
237                       duplicate(VECTOR_ELT(GET_SLOT(a, Matrix_DimNamesSym), 1)));
238        SET_VECTOR_ELT(dn, 1,
239                       duplicate(VECTOR_ELT(GET_SLOT(b_M, Matrix_DimNamesSym), 1)));
240        return chm_dense_to_SEXP(chc, 1, 0, dn);
241  }  }
242    
243    /* Computes   x'x  or  x x'  -- see Csparse_Csparse_crossprod above for  x'y and x y' */
244  SEXP Csparse_crossprod(SEXP x, SEXP trans, SEXP triplet)  SEXP Csparse_crossprod(SEXP x, SEXP trans, SEXP triplet)
245  {  {
246      int trip = asLogical(triplet),      int trip = asLogical(triplet),
# Line 182  Line 256 
256          chxt = cholmod_transpose(chx, chx->xtype, &c);          chxt = cholmod_transpose(chx, chx->xtype, &c);
257      chcp = cholmod_aat((!tr) ? chxt : chx, (int *) NULL, 0, chx->xtype, &c);      chcp = cholmod_aat((!tr) ? chxt : chx, (int *) NULL, 0, chx->xtype, &c);
258      if(!chcp)      if(!chcp)
259          error("Csparse_crossprod(): error return from cholmod_aat()");          error(_("Csparse_crossprod(): error return from cholmod_aat()"));
260      cholmod_band_inplace(0, chcp->ncol, chcp->xtype, chcp, &c);      cholmod_band_inplace(0, chcp->ncol, chcp->xtype, chcp, &c);
261      chcp->stype = 1;      chcp->stype = 1;
262      if (trip) {      if (trip) {
# Line 195  Line 269 
269                                  /* create dimnames */                                  /* create dimnames */
270      SET_VECTOR_ELT(dn, 0,      SET_VECTOR_ELT(dn, 0,
271                     duplicate(VECTOR_ELT(GET_SLOT(x, Matrix_DimNamesSym),                     duplicate(VECTOR_ELT(GET_SLOT(x, Matrix_DimNamesSym),
272                                          (tr) ? 1 : 0)));                                          (tr) ? 0 : 1)));
273      SET_VECTOR_ELT(dn, 1, duplicate(VECTOR_ELT(dn, 0)));      SET_VECTOR_ELT(dn, 1, duplicate(VECTOR_ELT(dn, 0)));
274      UNPROTECT(1);      UNPROTECT(1);
275      return chm_sparse_to_SEXP(chcp, 1, 0, 0, "", dn);      return chm_sparse_to_SEXP(chcp, 1, 0, 0, "", dn);
276  }  }
277    
278    SEXP Csparse_drop(SEXP x, SEXP tol)
279    {
280        cholmod_sparse *chx = as_cholmod_sparse(x),
281            *ans = cholmod_copy(chx, chx->stype, chx->xtype, &c);
282        double dtol = asReal(tol);
283        int Rkind = (chx->xtype != CHOLMOD_PATTERN) ? Real_kind(x) : 0;
284    
285        if(!cholmod_drop(dtol, ans, &c))
286            error(_("cholmod_drop() failed"));
287        Free(chx);
288        return chm_sparse_to_SEXP(ans, 1, 0, Rkind, "",
289                                  GET_SLOT(x, Matrix_DimNamesSym));
290    }
291    
292    
293  SEXP Csparse_horzcat(SEXP x, SEXP y)  SEXP Csparse_horzcat(SEXP x, SEXP y)
294  {  {
295      cholmod_sparse *chx = as_cholmod_sparse(x),      cholmod_sparse *chx = as_cholmod_sparse(x),
# Line 228  Line 317 
317  SEXP Csparse_band(SEXP x, SEXP k1, SEXP k2)  SEXP Csparse_band(SEXP x, SEXP k1, SEXP k2)
318  {  {
319      cholmod_sparse *chx = as_cholmod_sparse(x), *ans;      cholmod_sparse *chx = as_cholmod_sparse(x), *ans;
320      int Rkind = (chx->xtype == CHOLMOD_REAL) ? Real_kind(x) : 0;      int Rkind = (chx->xtype != CHOLMOD_PATTERN) ? Real_kind(x) : 0;
321    
322      ans = cholmod_band(chx, asInteger(k1), asInteger(k2), chx->xtype, &c);      ans = cholmod_band(chx, asInteger(k1), asInteger(k2), chx->xtype, &c);
323      Free(chx);      Free(chx);
324      return chm_sparse_to_SEXP(ans, 1, 0, Rkind, "", R_NilValue);      return chm_sparse_to_SEXP(ans, 1, 0, Rkind, "",
325                                  GET_SLOT(x, Matrix_DimNamesSym));
326  }  }
327    
328  SEXP Csparse_diagU2N(SEXP x)  SEXP Csparse_diagU2N(SEXP x)
329  {  {
330        if (*diag_P(x) != 'U') {/* "trivially fast" when there's no 'diag' slot at all */
331            return (x);
332        }
333        else {
334      cholmod_sparse *chx = as_cholmod_sparse(x);      cholmod_sparse *chx = as_cholmod_sparse(x);
335      cholmod_sparse *eye = cholmod_speye(chx->nrow, chx->ncol, chx->xtype, &c);      cholmod_sparse *eye = cholmod_speye(chx->nrow, chx->ncol, chx->xtype, &c);
336      double one[] = {1, 0};      double one[] = {1, 0};
337      cholmod_sparse *ans = cholmod_add(chx, eye, one, one, TRUE, TRUE, &c);      cholmod_sparse *ans = cholmod_add(chx, eye, one, one, TRUE, TRUE, &c);
338      int uploT = (strcmp(CHAR(asChar(GET_SLOT(x, Matrix_uploSym))), "U")) ?          int uploT = (*uplo_P(x) == 'U') ? 1 : -1;
339          -1 : 1;          int Rkind = (chx->xtype != CHOLMOD_PATTERN) ? Real_kind(x) : 0;
     int Rkind = (chx->xtype == CHOLMOD_REAL) ? Real_kind(x) : 0;  
340    
341      Free(chx); cholmod_free_sparse(&eye, &c);      Free(chx); cholmod_free_sparse(&eye, &c);
342      return chm_sparse_to_SEXP(ans, 1, uploT, Rkind, "N",      return chm_sparse_to_SEXP(ans, 1, uploT, Rkind, "N",
343                                duplicate(GET_SLOT(x, Matrix_DimNamesSym)));                                    GET_SLOT(x, Matrix_DimNamesSym));
344        }
345  }  }
346    
347  SEXP Csparse_submatrix(SEXP x, SEXP i, SEXP j)  SEXP Csparse_submatrix(SEXP x, SEXP i, SEXP j)
# Line 255  Line 349 
349      cholmod_sparse *chx = as_cholmod_sparse(x);      cholmod_sparse *chx = as_cholmod_sparse(x);
350      int rsize = (isNull(i)) ? -1 : LENGTH(i),      int rsize = (isNull(i)) ? -1 : LENGTH(i),
351          csize = (isNull(j)) ? -1 : LENGTH(j);          csize = (isNull(j)) ? -1 : LENGTH(j);
352      int Rkind = (chx->xtype == CHOLMOD_REAL) ? Real_kind(x) : 0;      int Rkind = (chx->xtype != CHOLMOD_PATTERN) ? Real_kind(x) : 0;
353    
354      if (rsize >= 0 && !isInteger(i))      if (rsize >= 0 && !isInteger(i))
355          error(_("Index i must be NULL or integer"));          error(_("Index i must be NULL or integer"));
356      if (csize >= 0 && !isInteger(j))      if (csize >= 0 && !isInteger(j))
357          error(_("Index j must be NULL or integer"));          error(_("Index j must be NULL or integer"));
358    
359      return chm_sparse_to_SEXP(cholmod_submatrix(chx, INTEGER(i), rsize,      return chm_sparse_to_SEXP(cholmod_submatrix(chx, INTEGER(i), rsize,
360                                                  INTEGER(j), csize,                                                  INTEGER(j), csize,
361                                                  TRUE, TRUE, &c),                                                  TRUE, TRUE, &c),
362                                1, 0, Rkind, "", R_NilValue);                                1, 0, Rkind, "",
363                                  /* FIXME: drops dimnames */ R_NilValue);
364  }  }

Legend:
Removed from v.1555  
changed lines
  Added in v.1893

root@r-forge.r-project.org
ViewVC Help
Powered by ViewVC 1.0.0  
Thanks to:
Vienna University of Economics and Business University of Wisconsin - Madison Powered By FusionForge