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[matrix] Annotation of /branches/Matrix-mer2/src/dtpMatrix.c
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Annotation of /branches/Matrix-mer2/src/dtpMatrix.c

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Revision 591 - (view) (download) (as text)
Original Path: pkg/src/dtpMatrix.c

1 : bates 591 /* double (precision) Triangular Packed Matrices */
2 :    
3 :     #include "dtpMatrix.h"
4 :    
5 :     SEXP dtpMatrix_validate(SEXP obj)
6 :     {
7 :     SEXP val;
8 :    
9 :     if (isString(val = check_scalar_string(GET_SLOT(obj, Matrix_uploSym),
10 :     "LU", "uplo"))) return val;
11 :     if (isString(val = check_scalar_string(GET_SLOT(obj, Matrix_diagSym),
12 :     "NU", "diag"))) return val;
13 :     return ScalarLogical(1);
14 :     }
15 :    
16 :     static
17 :     double get_norm(SEXP obj, char *typstr)
18 :     {
19 :     char typnm[] = {'\0', '\0'};
20 :     int *dims = INTEGER(GET_SLOT(obj, Matrix_DimSym));
21 :     double *work = (double *) NULL;
22 :    
23 :     typnm[0] = norm_type(typstr);
24 :     if (*typnm == 'I') {
25 :     work = (double *) R_alloc(dims[0], sizeof(double));
26 :     }
27 :     return F77_CALL(dlantp)(typnm,
28 :     CHAR(asChar(GET_SLOT(obj, Matrix_uploSym))),
29 :     CHAR(asChar(GET_SLOT(obj, Matrix_diagSym))),
30 :     dims, REAL(GET_SLOT(obj, Matrix_xSym)), work);
31 :     }
32 :    
33 :     SEXP dtpMatrix_norm(SEXP obj, SEXP type)
34 :     {
35 :     return ScalarReal(get_norm(obj, CHAR(asChar(type))));
36 :     }
37 :    
38 :     static
39 :     double set_rcond(SEXP obj, char *typstr)
40 :     {
41 :     char typnm[] = {'\0', '\0'};
42 :     SEXP rcv = GET_SLOT(obj, Matrix_rcondSym);
43 :     double rcond = get_double_by_name(rcv, typnm);
44 :    
45 :     typnm[0] = rcond_type(typstr);
46 :     if (R_IsNA(rcond)) {
47 :     int *dims = INTEGER(GET_SLOT(obj, Matrix_DimSym)), info;
48 :     F77_CALL(dtpcon)(typnm,
49 :     CHAR(asChar(GET_SLOT(obj, Matrix_uploSym))),
50 :     CHAR(asChar(GET_SLOT(obj, Matrix_diagSym))),
51 :     dims, REAL(GET_SLOT(obj, Matrix_xSym)),
52 :     &rcond,
53 :     (double *) R_alloc(3*dims[0], sizeof(double)),
54 :     (int *) R_alloc(dims[0], sizeof(int)), &info);
55 :     SET_SLOT(obj, Matrix_rcondSym,
56 :     set_double_by_name(rcv, rcond, typnm));
57 :     }
58 :     return rcond;
59 :     }
60 :    
61 :     SEXP dtpMatrix_rcond(SEXP obj, SEXP type)
62 :     {
63 :     return ScalarReal(set_rcond(obj, CHAR(asChar(type))));
64 :     }
65 :    
66 :    
67 :     SEXP dtpMatrix_solve(SEXP a)
68 :     {
69 :     SEXP val = PROTECT(duplicate(a));
70 :     int info, *Dim = INTEGER(GET_SLOT(val, Matrix_DimSym));
71 :     F77_CALL(dtptri)(CHAR(asChar(GET_SLOT(val, Matrix_uploSym))),
72 :     CHAR(asChar(GET_SLOT(val, Matrix_diagSym))),
73 :     Dim, REAL(GET_SLOT(val, Matrix_xSym)), &info);
74 :     UNPROTECT(1);
75 :     return val;
76 :     }
77 :    
78 :     SEXP dtpMatrix_matrix_solve(SEXP a, SEXP b)
79 :     {
80 :     SEXP val = PROTECT(duplicate(b));
81 :     int *Dim = INTEGER(GET_SLOT(a, Matrix_DimSym)),
82 :     *bDim = INTEGER(getAttrib(val, R_DimSymbol));
83 :     int ione = 1, j;
84 :    
85 :     if (bDim[0] != Dim[1])
86 :     error(_("Dimensions of a (%d,%d) and b (%d,%d) do not conform"),
87 :     Dim[0], Dim[1], bDim[0], bDim[1]);
88 :     for (j = 0; j < bDim[1]; j++)
89 :     F77_CALL(dtpsv)(CHAR(asChar(GET_SLOT(val, Matrix_uploSym))),
90 :     "N", CHAR(asChar(GET_SLOT(val, Matrix_diagSym))),
91 :     bDim, REAL(GET_SLOT(a, Matrix_xSym)),
92 :     REAL(val) + j * bDim[0], &ione);
93 :     UNPROTECT(1);
94 :     return val;
95 :     }
96 :    
97 :     SEXP dtpMatrix_as_dtrMatrix(SEXP from)
98 :     {
99 :     SEXP val = PROTECT(NEW_OBJECT(MAKE_CLASS("dtrMatrix"))),
100 :     uplo = GET_SLOT(from, Matrix_uploSym),
101 :     diag = GET_SLOT(from, Matrix_diagSym),
102 :     dimP = GET_SLOT(from, Matrix_DimSym);
103 :     int n = *INTEGER(dimP);
104 :    
105 :     SET_SLOT(val, Matrix_rcondSym,
106 :     duplicate(GET_SLOT(from, Matrix_rcondSym)));
107 :     SET_SLOT(val, Matrix_DimSym, duplicate(dimP));
108 :     SET_SLOT(val, Matrix_diagSym, duplicate(diag));
109 :     SET_SLOT(val, Matrix_uploSym, duplicate(uplo));
110 :     packed_to_full(REAL(ALLOC_SLOT(val, Matrix_xSym, REALSXP, n*n)),
111 :     REAL(GET_SLOT(from, Matrix_xSym)), n,
112 :     *CHAR(STRING_ELT(uplo, 0)) == 'U' ? UPP : LOW);
113 :     UNPROTECT(1);
114 :     return val;
115 :     }
116 :    
117 :     SEXP dtrMatrix_as_dtpMatrix(SEXP from)
118 :     {
119 :     SEXP val = PROTECT(NEW_OBJECT(MAKE_CLASS("dtpMatrix"))),
120 :     uplo = GET_SLOT(from, Matrix_uploSym),
121 :     diag = GET_SLOT(from, Matrix_diagSym),
122 :     dimP = GET_SLOT(from, Matrix_DimSym);
123 :     int n = *INTEGER(dimP);
124 :    
125 :     SET_SLOT(val, Matrix_rcondSym,
126 :     duplicate(GET_SLOT(from, Matrix_rcondSym)));
127 :     SET_SLOT(val, Matrix_DimSym, duplicate(dimP));
128 :     SET_SLOT(val, Matrix_diagSym, duplicate(diag));
129 :     SET_SLOT(val, Matrix_uploSym, duplicate(uplo));
130 :     full_to_packed(REAL(ALLOC_SLOT(val, Matrix_xSym, REALSXP, (n*(n+1))/2)),
131 :     REAL(GET_SLOT(from, Matrix_xSym)), n,
132 :     *CHAR(STRING_ELT(uplo, 0)) == 'U' ? UPP : LOW,
133 :     *CHAR(STRING_ELT(diag, 0)) == 'U' ? UNT : NUN);
134 :     UNPROTECT(1);
135 :     return val;
136 :     }

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